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高光谱成像显微镜结合机器学习实现对神经干细胞培养物的无标记分类

发布:HPLlaser阅读:2457时间:2019-2-13 11:47:35

近年来由于生物医学领域对无标记观察方法的需求不断增长,已经研究了许多可行技术,例如定量相位成像和拉曼光谱,同时引入了补充方法:高光谱成像。本文开发了一种采用市售设备的高速高光谱显微成像方法,采用液晶可调带通滤波器结合像素式机器学习分类细胞。另外,本文评估了将该方法用于使用神经干细胞的干细胞研究的可行性。采用这种显微镜方法,在562×562μm^2视场下,可以在30秒内获得包含63个波长像素式光谱的2048×2048像素分辨率的图像。将神经干细胞分化为神经元和星形胶质细胞(神经胶质细胞),并在共培养条件下进行四类(包括神经元细胞体,神经胶质细胞体,分化过程和细胞外区域)细胞分类评估。结果,平均88%的目标对象被正确分类,平均精度为94%,并且超过99%的细胞外像素被正确分离。这些结果表明,本文所提出的高光谱成像显微镜作为干细胞研究的无标记观察方法是可行的。
 

a)用于分类的输入图像;b)图像a)的分类结果:蓝色为神经元细胞体,红色为神经胶质细胞体,绿色为分化过程,灰色为外部区域;神经细胞体c)和神经胶质细胞体d)的单类结果图像:真阳性以绿色显示,假阳性以蓝色显示,假阴性以红色显示。

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