1 湖南大学生物学院, 长沙 410082
2 湖南大学生物学院, 长沙 410082南华生物医药股份有限公司, 长沙 410006
3 2.南华生物医药股份有限公司, 长沙 410006
4 南华生物医药股份有限公司, 长沙 410006
微卫星( microsatellites)在新型冠状病毒( SARS-CoV-2)的基因组表达调控、种群遗传进化以及宿主免疫互作调节方面发挥重要作用。该研究利用 NCBI数据库以及微卫星分析系统筛选并测试 SARS-CoV-2原株及变体中不同微卫星数量与遗传特征的关联, 探索影响 SARS-CoV-2遗传多样性的微卫星特征。通过生物信息学分析, 构建 SARS-CoV-2的全基因组序列库, 并收集关于序列库的遗传特征、微卫星数量以及微卫星相对位置分布特征信息；通过生物统计学分析, 对不同微卫星数量进行相关性测试以及单样本 Wilcoxon符号秩非参数检验。结果表明, SARS-CoV-2的原株与变体(除 Lambda和 Omicron)中不同微卫星数量、占比与相对位置分布特征相似。 2核苷酸重复( 77%～78%)、3次基序重复( 22%～23%)以及全长 6 bp(73%)的微卫星占比较高, 而 ORF3a(0.48/100 bp)、 E(0.44/100 bp)与 N(0.40/100 bp)3个编码区序列的微卫星密度也较高。总平均微卫星数量与碱基含量间存在显著的负相关性( r: – 0.799 6；P: 0.009 7), 但与碱基替换量无显著相关性。本研究丰富了分子生物学领域对 SARS-CoV-2的遗传多样性以及进化机制的研究, 并为新型冠状病毒感染疫情的防治提供了新思路。
新型冠状病毒 微卫星 遗传多样性 碱基含量偏向性 种群遗传进化
1 新疆师范大学地理科学与旅游学院, 新疆 乌鲁木齐 830054
2 新疆干旱区湖泊环境与资源重点实验室, 新疆 乌鲁木齐 830054
为研究新型冠状病毒肺炎疫情防控期间乌鲁木齐市空气质量变化特征及其影响因素，选取了2020年乌鲁木齐市两次疫情严格防控期间 (2020年1月26日至3月21日和7月20至8月29日) 及疫情前后，以及2019年相同时期地面观测站的逐小时空气质量指数 (AQI)、颗粒污染物 (PM2.5、PM10) 和气态污染物 (SO2、NO2、CO、O3) 的数据进行对比分析，探究了气态污染物对颗粒污染物二次合成的贡献，并利用地理探测器对影响空气质量的因子进行了定量探测。结果表明：与2019年同期相比，2020年乌鲁木齐市两次疫情防控期间，除O3外，PM2.5、PM10、SO2、NO2和CO浓度都呈现下降趋势，分别减少了36%、55%、10%、18%和49%；而同疫情严格防控期相比，2020年疫情前后期的AQI、颗粒污染物浓度及气态污染物浓度都要高。说明疫情防控措施在一定程度上减少了乌鲁木齐市颗粒污染物和气体污染的浓度，改善了空气质量。单因子探测结果显示空气污染指标中CO和PM2.5是主导因子，气象因子中气温对空气质量的影响相对较大；交互因子探测结果表明，空气污染物PM2.5和PM10在其他因子的交互作用下对AQI的影响最明显，而气象因子中相对湿度结合其他因子的交互作用对AQI影响较明显。说明乌鲁木齐市的空气质量是多种因子相互作用的结果。本研究为乌鲁木齐市空气质量改善和大气污染防治工作提供了理论参考。
新型冠状病毒肺炎 空气质量 大气污染物 颗粒污染物二次合成 地理探测器 COVID-19 air quality air pollutants secondary synthesis of particulate contaminants geographical detector 大气与环境光学学报
2023, 18(5): 479
1 太原科技大学, 山西省精密测量与在线检测装备工程研究中心, 应用科学学院, 山西 太原 030024
2 山西瑞豪生物科技有限公司, 山西 太原 030025
目前, 核酸检测已成为了我国新型冠状病毒感染确诊的“金标准”, 然而核酸检测在检测过程中受到病程、 标本采集、 检测过程、 检测试剂等因素的影响, 容易出现检测结果“假阴性”而漏诊的情况。 检测血清中的新型冠状病毒特异性IgM和IgG抗体已作为新冠病毒检测的辅助手段, 可以用来弥补核酸检测的“假阴性”短板, 提高检测阳性率。 论文介绍了一种成本低的便携式新冠IgM和IgG抗体定量检测仪。 检测仪由CPU信号处理模块、 光源驱动模块、 多光谱探测模块、 电源模块、 显示存储和通信模块等组成。 采用荧光免疫层析技术使待测样本中的IgM和IgG抗体与量子点相结合, 并将其截留在试纸条的T线。 方波调制后的光源驱动模块驱动紫外LED, 其出射紫外光通过一种屋脊形的光学系统垂直照射在免疫荧光层析试纸条的T线和C线上, 量子点标记物被光源激发辐射出红色荧光, 红色荧光透过窄带滤光片后被多光谱探测模块所捕获； 多光谱信号在CPU中进行FFT变换得到其频谱特征量, 利用信号波段和参考波段的特征量的比值进行归一化处理消除背景和环境干扰信号计算得到荧光强度, 根据标定系数, 从而确定IgM和IgG抗体的含量。 最终检测结果显示到UI界面上同时上传到服务器数据库中, 可通过计算机端进行远程查询实现数据共享和信息化管理。 采用正常人血清样本作为测量试剂, 进行了重复性实验, 实验表明, CV值在0～8.30%之间, 其中T线的CV值仅为3.45%。 将含有IgG与IgM抗体的溶液, 利用梯度稀释法得到一系列不同质量浓度的样品溶液进行线性度实验, 采用线性度最小二乘法对检测结果进行曲线拟合, 拟合系数为0.997 5。 最后, 通过新冠疫苗血清抗体检测的实验表明, 检测仪的阳性检出率为75%。 该检测仪结构精巧、 功耗低、 操作简便、 性能良好, 可作为辅助手段有效提高新型冠状病毒感染的阳性检出率。
新型冠状病毒 多光谱探测 光谱分析 量子点 抗体定量检测 SARS-Cov-2 Multi-spectral detection Spectral analysis Quantum dots Antibody quantitative detection 光谱学与光谱分析
2023, 43(4): 1012
强激光与粒子束
2021, 33(11): 119001
强激光与粒子束
2020, 32(6): 069001
1 潍坊医学院, 潍坊 261053
2 潍坊医学院附属医院生殖医学中心, 潍坊 261031
病毒性肺炎是世界范围内人类常见病之一, 而近年由新型冠状病毒暴发引起的急性呼吸系统疾病严重威胁人类的健康。2019年12月以来, 暴发于中国武汉的2019新型冠状病毒(SARS-CoV-2)再一次引起全世界的高度关注, 被世界卫生组织(WHO)定为国际关注的突发公共卫生事件(PHEIC)。目前已经发现的可感染人的冠状病毒有7种, 其中4种冠状病毒在人群中比较常见, 致病性较低, 另外3种[严重急性呼吸综合征冠状病毒SARS-CoV(2002)、中东呼吸综合征冠状病毒MERS-CoV(2012)和SARS-CoV-2(2019)]所致疾病症状较重。孕妇作为特殊的易感人群, 一旦妊娠合并新型冠状病毒肺炎, 可能会对母胎造成影响, 但目前国内外对这方面的研究有限。为了尽可能地减少其对母胎产生不良后果, 我们应增加对这方面的研究。本文旨在通过对患有严重急性呼吸综合征(SARS)、中东呼吸综合征(MERS)和新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的妊娠妇女的妊娠结局进行综述, 为今后其他相关新型冠状病毒感染孕妇的监督和管理做出指导, 为减少母胎死亡率及做好预防工作提供临床依据。
妊娠合并症 感染性 新型冠状病毒感染 垂直传播 妊娠结局 complications of pregnancy infectious novel coronavirus infection vertical spread pregnancy outcome
湖南师范大学生命科学学院, 微生物分子生物学湖南省重点实验室, 淡水鱼类发育生物学国家重点实验室, 长沙 410081
在武汉发生的由新型冠状病毒SARS-CoV-2引发的人类冠状病毒病COVID-19, 仅仅2个多月时间在我国及国际上70多个国家出现迅速传播, 致病和死亡率高, 人类生命受到了极大威胁。一些科学家火速投入研究, 对SARS-CoV-2的来源和进化、形态特征和基因结构、感染和致病分子机制开展深入研究, 取得了重大进展, 为科学防控COVID-19提供了重要依据。根据上述研究的基础, 文中对COVID-19病毒疫苗、抗体和抑制剂研发提出了设想, 在研究防控COVID-19核心技术上具有一定的参考价值。
新型冠状病毒 受体 研究进展 new coronavirus SARS-CoV-2 SARS-CoV-2 COVID-19 COVID-19 receptor research progress
