黄世光 1,2,3,*靳翔宇 1林荣赞 1林雪 1[ ... ]黄国亮 1,4
作者单位
摘要
1 清华大学医学院, 北京 100084
2 北京航空航天大学北京学院, 北京100191
3 首都医科大学生物医学工程学院, 北京 100069
4 生物芯片北京国家工程研究中心, 北京 102206
目前临床病原菌检测主要依赖细菌培养的方法,该方法周期长、准确性低,且容易产生交叉污染和人体感染等问题。提出微流控芯片核酸恒温扩增分子诊断技术,开发离心进样空气隔离微流控芯片和共焦面成像光学检测系统,采用旋转扫描信号采集方法和薄层空气浴流动加热比例-积分-微分温控方法对呼吸道病原菌进行实验和分析。研制恒温扩增微流控芯片核酸分析系统,将系统检测灵敏度提高至10 copies,降低样品试剂消耗量至0.94 μL,在45 min内能够同时进行多种病原菌指标的并行分析鉴定。通过100例临床样品实验测试,得到所提系统与传统聚合酶链反应所得结果的总符合率大于98%,可满足医院、社区医疗、乡镇卫生诊所等低成本精准医疗应用的需要。
医用光学 生物医学光子学 核酸分析 分子诊断 精准医学 微流控芯片 恒温扩增 共焦面成像 
中国激光
2018, 45(3): 0307002
作者单位
摘要
华南师范大学生物光子学研究院, 激光生命科学研究所教育部重点实验室, 广东 广州 510631
近年来, 食源性致病菌在全球范围内大面积传播, 给人类的生存健康与发展带来了巨大的威胁。因此为了保证食品的安全, 快速的、高特异性且高灵敏地检测食品致病菌方法已经成为科学研究的热点话题。在本研究中, 我们构建了一种基于滚环扩增技术的纸基显色传感器用于可视化检测致病菌的检测平台。通过滚环扩增对单增李斯特菌的hlyA mRNA进行高效特异性扩增, 扩增后的单链产物经过Hhal酶进行特异位点酶切后, 形成与锁式探针长度相同的片段。将酶切后的单链产物不经过预变性杂交, 可直接进行试纸条检测。在优化的实验条件下, 可以检测到100 pg/μL总RNA。整个过程实验包括连接, 扩增, 酶切, 检测等反应均可在恒温条件下进行, 且可在几个小时内完成。这种方法适用于快速的现场检测, 此外, 这项研究强调了纸基显色诊断平台的潜在价值和应用前景。
纸基显色传感器 滚环扩增 恒温扩增 食源性致病菌 paper-based nucleic acid diagnostics padlock probe isothermal amplification pathogenic bacteria 
激光生物学报
2017, 26(6): 527
黄国亮 1,2,*田浩 2李志永 2王同舟 1[ ... ]邓涛 1
作者单位
摘要
1 清华大学医学院生物医学工程系, 北京 100084
2 生物芯片北京国家工程研究中心, 北京 102206
为了实现高灵敏度、快速、准确鉴定痕量病原菌核酸样品,介绍了一种痕量核酸样品高灵敏度快速测量方法,并发展了一种微流控芯片核酸等温扩增实时分子诊断技术,研制了新型微纳体系生化反应载体芯片。通过表面惰性处理降低芯片表面对生物分子的吸附影响,构建一种大数值孔径、长工作距离的便携式共焦光学检测系统,有效消除背景荧光的影响,提高了检测灵敏度。在微纳升(7 μL~40 nL)试剂消耗反应体系水平,实现检测灵敏度5个DNA分子拷贝数,并以呼吸道感染疾病的大肠埃希氏菌检测为例,开展临床应用研究,满足低成本临床医疗应用需要。
生物光学 微流控芯片 分子诊断 等温扩增 便携式共焦检测系统 
光学学报
2012, 32(2): 0217003
Author Affiliations
Abstract
1 Medical Systems Biology Research Center Tsinghua University School of Medicine Beijing, 100084, China
2 National Engineering Research Center for Beijing Biochip Technology Beijing, 102206, China
Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) is a novel nucleic acid amplification method. Compared with the widely utilized polymerase chain reaction (PCR), LAMP has higher speed and efficiency as well as lower requirement for system temperature control because the whole amplification process is isothermal and no efforts are needed to switch between different temperatures. In this paper, we designed and fabricated different kinds of polycarbonate (PC) microfluid chips, explored appropriate reaction condition for LAMP in microenvironment (1 nL→10 μL), and developed a microfluidic isothermal amplification detection system. The DNA optimal amplification temperature is obtained; the starting time of exponential amplification of DNA is put forward farther. The optimal condition of DNA amplification in microenvironment, with a little reaction materials and early starting exponential amplification time of DNA are very important for clinic DNA detection and the application of Lab-on-a-Chip.
Loop-mediated isothermal amplification Lab-on-a-Chip microfluid chips polymerase chain reaction DNA amplification 
Journal of Innovative Optical Health Sciences
2008, 1(2): 257–265

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