作者单位
摘要
1 广西科学院生物物理实验室, 广西 南宁 530007
2 广西大学行健文理学院, 广西 南宁 530004
3 广西职业技术学院食品与生物技术系, 广西 南宁 530226
4 美国东卡罗来那大学物理系, 北卡罗来那州格林维尔 NC27858
应用拉曼光谱学结合奇异值分解方法在单细胞尺度上对杀虫贪铜菌(C. necator) H16 菌株在不同的氮源下合成聚β-羟基丁酸(PHB)的代谢动态进行分析。结果显示,硫酸铵是PHB 发酵的理想氮源,对应PHB 发酵速度、效率和产量在测试氮源中表现最好。奇异值分解结果显示,源自RNA、DNA、蛋白质和PHB 的拉曼峰是发酵的主要特征,随着发酵进程的延伸,菌体细胞差异、产物含量差别逐渐增大。分析PHB 产物快速合成过程,可见表征核酸、蛋白质和PHB 的782、1574、1660、1732 cm-1 等峰的强度变化活跃;不同氮源下,782 cm-1 峰与1660 cm-1 峰的强度呈正相关,而1660 cm-1 峰与1732 cm-1 峰的强度呈负相关。因此,不同氮源可能影响细胞的RNA 代谢和蛋白质代谢,从而间接影响PHB 的合成。拉曼光谱结合数据挖掘技术可以分析微生物发酵过程中的代谢信息,从分子光谱的角度为寻找最佳的发酵条件提供新的信息。
生物光学 拉曼光谱 奇异值分解 氮源 聚β-羟基丁酸 单细胞分析 
光学学报
2016, 36(4): 0417001
作者单位
摘要
1 广西师范大学物理科学与技术学院, 广西 桂林 541004
2 广西大学行健文理学院, 广西 南宁 530004
3 广西科学院生物物理实验室, 广西 南宁 530007
4 河北省科学院生物研究所, 河北 石家庄 050051
应用激光镊子拉曼光谱实时监测杀虫贪铜菌(Cupriavidus necator) H16菌株在特定氮源、不同果糖浓度下生物塑料聚β-羟基丁酸(PHB)的合成过程及其生化动态,以期获知碳源浓度对PHB 合成的影响机制。结果显示:1) 2.0%果糖浓度(质量分数)下的PHB 产量获得最佳发酵效果;2) 发酵启动及发酵前期胞内物质的合成速度基本相同,但果糖浓度影响对数生长期的长短;3) 782、1574、1656和1732 cm-1等峰信号强度变化动态显示,高碳源浓度下核酸物质的拉曼信号长时间维持在较高的水平,这可能是影响细胞合成PHB 的重要因素;4) 单个细胞在1732 cm-1峰处的平均强度与发酵液PHB 总含量线性相关,可用于定量监测发酵过程中PHB 总量动态。发现了C. necator H16 菌株在不同碳源浓度下PHB 合成代谢过程中胞内主要生物大分子的变化动态,为PHB 发酵提供全新的光谱学信息,也为基于单细胞拉曼光谱快速分选高产优良菌株提供实验依据。
光谱学 拉曼光谱 单细胞分析 聚β-羟基丁酸 
中国激光
2015, 42(3): 0315003

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