针对复杂战场环境下同型号舰载雷达发射信号之间容易出现同频干扰的问题，设计出具有正交特性的调频编码信号。对常规的正交波形编码的搜索方向进行改进，利用混合遗传鸡群算法找出具有低自相关特性和低互相关特性的编码序列。该算法利用反向学习的鸡群算法进行搜索寻优，引入学习因子和遗传算法中的变异和交叉思想对个体进行更新迭代。在适应度函数中引入集对分析联系度综合评价，根据集对分析联系度来引导算法的搜索方向，得到具有更好正交特性的调频编码序列脉冲信号。对得到的雷达信号的模糊函数、回波信号的匹配滤波情况以及不同雷达数量下仿真信号的正交性分别进行仿真，仿真结果验证了所设计的调频编码信号能达到抗同频干扰的目的。