郑江鹏 1余平 1赵萌 1,*石凡 1,*[ ... ]陈胜勇 1
作者单位
摘要
1 学习型智能系统教育部工程研究中心, 天津理工大学计算机科学与工程学院, 天津 300384
2 天津医科大学医学检验学院, 天津 300203
由于低信噪比的小样本太赫兹光谱的可区分性特征提取困难和样本量过少带来的深度学习模型自身的过拟合问题,将太赫兹光谱与深度学习相结合应用于心肌淀粉样变检测仍面临挑战。本文提出了一种基于多模块顺序级联的分类模型,用于心肌淀粉样变在算法层面的实时检测。首先,采集了少量的低信噪比太赫兹光谱并对其进行预处理。其次,构建了一个基于卷积降噪自编码器、多尺度特征提取模块、密集连接模块的深度学习模型。最后,通过五折交叉验证策略进行病变预测,以获得稳定、可靠的结果。 10次独立重复实验和对比实验结果表明,该方法能对含噪光谱进行准确、稳定的分类,且其综合指标更优。不同样本量下的实验表明,本方法对样本量变化具有适应性:数据量为100时可达到95%的准确率;数据量仅为20时,该模型仍能取得70%的准确率。该项工作对心肌淀粉样变的实时、高效、安全诊断具有重要意义。
太赫兹光谱 心肌淀粉样变 低信噪比 小样本 深度学习 terahertz spectroscopy myocardial amyloidosis low signal to noise ratio a small number of samples deep learning 
中国光学
2022, 15(3): 443
作者单位
摘要
1 中南大学基础医学院免疫学系, 湖南 长沙 410078
2 长沙医学院基础医学院, 湖南 长沙 410219
3 南华大学附属第一医院检验科, 湖南 衡阳 421001
研究MICA等位基因多态性与海南人群HBV感染易感性之间的关联性。采用PCR-SSP和PCR-SBT方法对样本MICA等位基因的多态性进行检测。HBV感染患者中共检出10 种MICA 等位基因和5种MICA-STR等位基因,和对照组相比较,MICA*010、MICA-A5等位基因可能对HBV感染易感(MICA*010: OR=3.88,95%CI: 2.19~6.85,P=0.000; MICA-A5: OR=1.27,95%CI: 0.92~1.77,P=0.0068)。MICA*008/045基因型可能对HBV感染不易感,MICA*010/010 纯合子基因型可能对HBV易感(MICA* 008/045: OR=0.09,95%CI: 0.01~1.74,P=0.0071; MICA*010/010: OR=4.41,95%CI: 1.26~15.46,P=0.0106)。MICA等位基因多态性与海南人群HBV感染的易感性间存在关联性。
MICA 基因 基因多态性 HBV感染 MICA alleles gene polymorphism HBV infection 
激光生物学报
2019, 28(1): 54
作者单位
摘要
中南大学湘雅医学院免疫系, 湖南 长沙 410000
目的: 探讨T淋巴细胞酶联斑点实验(T-SPOT)、结核菌素皮肤试验(tuberculin test, TST)以及结核抗体(tuberculosis antibody)在矽肺合并肺结核(pulmonary silicosis complicated with tuberculosis)诊断中的应用价值。方法: 收集2015年8月7日至2016年5月20日确诊为矽肺结核感染患者41例、非矽肺结核患者90例、健康体检学生对照组40例, 对三组人群经以上免疫学方法检测的结果进行统计分析。结果: 1)矽肺结核、非矽肺结核及健康人群中T-SPOT阳性率分别为73.17%、93.33%、15%, 三者两两比较差异有统计学意义; 矽肺结核、非矽肺结核及健康人群中TST阳性率分别为58.54%、88.89%、32.5%, 非矽肺结核患者与健康人群及矽肺结核患者之间, 差异均有统计学意义, 但矽肺结核患者与健康人群之间, 差异无统计学意义; 矽肺结核、非矽肺结核及健康人群中结核抗体阳性率分别为36.58%、42.22%、52.5%, 三者两两比较差异均无统计学意义。2)三种检测方法在矽肺结核患者中的敏感性分别为73.17%、58.54%、36.58%, 差异有统计学意义, 其中T-SPOT及TST的敏感性均高于结核抗体方法(P<0.05); 特异性分别为85%、67.5%、47.5%, 其中T-SPOT的特异性高于结核抗体方法(P<0.05); 阳性预测值分别为83.33%、64.86%、41.67%, 阴性预测值分别为75.56%、61.36%、42.22%, 三种方法的阳性及阴性预测值存在差异, 均有统计学意义。3)T-SPOT在I、II、III期矽肺结核检测的阳性率分别为52.38%、94.12%、100%, I期与II期或III期的阳性率之间差异有统计学意义, II期与III期之间阳性率差异无统计学意义。结论: T-SPOT方法具有较高的敏感性及特异性, 对矽肺结核辅助诊断及临床分期具有较好的应用价值。
尘肺结核 结核抗体 诊断方法 pneumoconiosis T-SPOT T-SPOT TST TST tuberculosis antibody diagnostic method 
激光生物学报
2017, 26(5): 443
作者单位
摘要
1 中南大学基础医学院免疫学系, 湖南 长沙 410078
2 长沙医学院病理生理学教研室, 湖南 长沙 410200
目的: 探讨贵州侗族健康人群MICB等位基因的分布特点。方法: 收集100例健康无亲缘关系的贵州侗族人新鲜血液样本, 采用世界卫生组织(WHO)推荐的标准盐析法从样本新鲜血液中提取基因组DNA, 并用PCR-SSP、PCR-SBT两种方法对样本DNA进行MICB等位基因分型。结果: 在贵州侗族人群中, 检出7种MICB等位基因, 其中MICB*005: 02等位基因频率最高, 其频率为58.50%, 其次为MICB*002: 01等位基因频率22.00%; 而MICB*003及MICB*005: 03等位基因频率最低, 两者频率分别为1.50%。结论: 贵州侗族人群MICB等位基因具有高度的多态性, 该数据为研究MICB基因在同种异体器官移植和疾病易感性中的可能作用奠定了实验基础。
基因多态性 MICB基因 贵州侗族 gene polymorphism MICB alleles Dong nationality of Guizhou 
激光生物学报
2017, 26(2): 162
作者单位
摘要
中南大学基础医学院免疫学系, 湖南 长沙 410078
目的: 探索沙眼衣原体(Chlamydia trachomatis, Ct)持续感染状态下, NOD1、IL-6及STAT3分子的表达情况和相互关系。方法: 利用HeLa229细胞或STAT3基因沉默的HeLa229细胞, 分别建立沙眼衣原体的急性感染和持续感染模型; 应用Western Blot及ELISA等方法检测不同感染状态下STAT3及NOD1 蛋白表达水平以及细胞因子IL-6的分泌水平。结果: HeLa229细胞在Ct感染状态下, STAT3和NOD1以及IL-6表达水平均升高, 且于持续感染状态下的升高较急性感染状态下的升高更明显; 沉默STAT3基因后, Ct感染的细胞NOD1及IL-6的表达水平下降明显。结论: HeLa229细胞在Ct持续感染状态下, STAT3能上调NOD1及IL-6表达水平, 上述分子间存在NOD1-IL-6-STAT3正反馈信号通路。
沙眼衣原体 持续感染 Chlamydia trachomatis persistent infection NOD1 NOD1 IL-6 IL-6 STAT3 STAT3 
激光生物学报
2017, 26(1): 61
作者单位
摘要
1 中南大学湘雅医学院免疫学系, 湖南 长沙 410008
2 .江西省肿瘤医院检验科, 江西 南昌 330029
目的: 研究海南汉族人群MICB等位基因的多态性与乳腺癌易感性之间的关联性。方法: 采用PCR-SSP(PCR sequence-specific primers) 和PCR-SBT(PCR sequence-based typing)方法对样本MICB等位基因的多态性进行检测。结果: 乳腺癌患者中检出14种MICB等位基因; 和对照组相比较, MICB* 002和MICB* 014等位基因在乳腺癌患者组分布频率较少, MICB*002和MICB* 014等位基因可能对乳腺癌不易感( MICB*002: OR=0.31, 95% CI: 0.19-0.51, Pc<0.05; MICB*014: OR=0.32, 95% CI: 0.17-0.60, Pc<0.05)。MICB* 016和MICB* 003等位基因在乳腺癌患者组分布较多; MICB *016和MICB* 003等位基因可能对乳腺癌易感( MICB *016: OR=10.68, 95% CI: 2.52-45.28, Pc<0.05; MICB *003: OR=3.57, 95% CI: 1.34-9.49, Pc<0.05); MICB*002/002和MICB*014/014基因型可能对乳腺癌不易感(MICB*002/002: OR=0.12, 95% CI: 0.04-0.36, Pc<0.05; MICB*014/014: OR=0.30, 95% CI: 0.10-0.89, Pc<0.05)。结论: MICB等位基因的多态性与乳腺癌的易感性之间存在关联性。
MICB 基因 基因多态性 乳腺癌 MICB alleles gene polymorphism breast cancer 
激光生物学报
2016, 25(2): 136
作者单位
摘要
1 中南大学湘雅医学院免疫学系, 湖南 长沙 410008
2 江西省肿瘤医院检验科, 江西 南昌 330029
目的:研究海南汉族人群MICB等位基因的多态性与肺癌易感性之间的关联性。方法:采用PCR-SSP(PCR sequence-specific primers) 和PCR-SBT(PCR sequence-based typing)方法对样本MICB等位基因的多态性进行检测。结果:肺癌患者中检出14种MICB等位基因;和对照组相比较,MICB* 00502等位基因在肺癌患者组分布频率较少(43.5% vs 57.8%),MICB* 016等位基因在肺癌患者组分布较多(5.9% vs 0.6%);MICB *016等位基因可能对肺癌易感(OR=11.19,95% CI:2.59-48.24,Pc<0.05);MICB*00502等位基因可能对肺癌不易感( MICB*00502:OR=0.56,95% CI:0.42-0.76,Pc<0.05)。结论:MICB等位基因的多态性与肺癌的易感性之间存在关联性。
MICB 基因 基因多态性 肺癌 MICB alleles gene polymorphism lung cancer 
激光生物学报
2016, 25(1): 69
作者单位
摘要
中南大学基础医学院免疫学系, 湖南 长沙 410008
目的:研究海南汉族人群MICA等位基因的多态性与乳腺癌的相关性.方法:采用PCR-SSP和PCR-SBT方法对样本MICA等位基因的多态性进行检测分析.结果:乳腺癌患者中有检测出10 种MICA 等位基因,其中MICA*002/019基因型频率较对照组显著偏低(OR=0.32,Pc<0.05).结论:MICA*002/019基因型可能与乳腺癌的保护相关.
MICA 基因 基因多态性 乳腺癌 MICA alleles gene polymorphism breast cancer 
激光生物学报
2015, 24(2): 170
作者单位
摘要
中南大学湘雅医学院免疫学系, 湖南 长沙 410008
目的: 对MTT法检测悬浮细胞增殖活性的实验条件进行筛选。方法: 以K562细胞为实验对象, 分别测定不同MTT用量、细胞浓度、MTT溶剂种类及作用时间等实验条件下的OD570值。结果: 检测K562细胞的增殖活性时, 细胞浓度应选取0.8×108 ~ 0.2×108/L, MTT加入量不应超过20 μL/孔, 若不考虑时间成本, 应以三联溶液作为甲臢溶剂, 反应12 h后检测, 所获结果精密度最高; 若需快速获得结果, 也可选择DMSO作为甲臢溶剂, 反应10 min后检测。结论: 建立了优化的MTT法检测悬浮细胞增殖活性。
MTT法 优化 悬浮细胞 MTT assay optimization suspension cell 
激光生物学报
2014, 23(3): 279
张宁洁 1,*张丽娜 1李伟 1林琳 1[ ... ]余平 1
作者单位
摘要
1 中南大学基础医学院免疫系, 湖南 长沙 410008
2 长治医学院基础部免疫学教研室, 山西, 长治 046000
目的: 构建针对IL-1α基因的shRNA表达载体, 筛选能够抑制Hela229细胞内源性IL-1α表达的shRNA, 建立无内源性IL-1α表达的Hela229稳定细胞系。方法: 根据shRNA的设计原则, 以IL-1αcDNA oligo为模板设计一段21 bp核苷酸目标序列, 构建成siRNA的DNA模板并克隆到shRNA表达载体pRNAT-U6.1/Neo中, 获得靶向抑制IL-1α基因的重组shRNA质粒, 转染Hela229细胞, 经G418筛选后获得单克隆稳定细胞株, 用ELISA方法在蛋白水平上检测IL-1α基因的沉默效果。结果: 经酶切鉴定和测序分析确定IL-1α-shRNA重组质粒构建正确, ELISA筛选出能够显著抑制内源性IL-1α表达的shRNA, 获得沉默内源性IL-1α表达的单克隆稳定的Hela229细胞株。结论: 靶向IL-1α基因的重组shRNA表达质粒可显著抑制Hela229细胞内源性IL-1α的表达, 成功构建靶向IL-1α基因沉默的Hela229稳定细胞系。
Hela229细胞 IL-1α IL-1α Hela229 cell shRNA shRNA 
激光生物学报
2013, 22(5): 441

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