姚悦 1,2裴浩杰 1,2李浩 3万嘉晨 1,2[ ... ]马辉 1,2,*
作者单位
摘要
1 清华大学深圳国际研究生院,广东 深圳 518055
2 广东省偏振光学检测与成像工程技术研究中心,广东 深圳 518055
3 北京大学深圳医院病理科,广东 深圳 518036
数字病理技术利用经过数字化的病理样本显微图像及其特征,并配合人工智能技术,实现生物组织病变特征的定量评估和判定,辅助临床医生做出诊断结论。利用偏振光照明和偏振探测可以实现全偏振成像,图像每个像素的偏振特征都包含更加丰富的信息,特别是普通光学成像难以获得的亚细胞超分辨微观结构特征信息,可为病变组织的识别和定量评估提供更为有效的手段。本文总结了全偏振成像技术,并结合典型临床应用归纳总结了全偏振显微图像的数据分析方法和最新进展。
医用光学 全偏振显微成像 偏振数字病理 偏振特征提取 机器学习 
中国激光
2024, 51(9): 0907008
吴寅 1,2梁永 1,2张洁 2李辉 1,2,*
作者单位
摘要
1 中国科学技术大学生物医学工程学院(苏州),生命科学与医学部,江苏 苏州 215163
2 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,江苏省医用光学重点实验室,江苏 苏州 215163
人类表皮生长因子受体-2(HER2)的异常扩增会导致癌细胞的过度增殖和肿瘤恶化。在采用常规光学显微成像技术检测扩增水平较高的乳腺癌细胞HER2基因时,荧光原位杂交探针的荧光信号斑点呈簇状分布,难以精确计数。应用结构光照明超分辨成像技术对HER2基因荧光原位杂交的病理切片进行成像,从而分辨距离较近的荧光探针。通过大视场扫描成像和图像拼接,对数百个细胞进行成像和统计分析,提高了高扩增水平病理切片上HER2探针计数的准确性。
乳腺癌病理诊断 荧光原位杂交 结构光照明超分辨成像 图像拼接 
激光与光电子学进展
2024, 61(4): 0411009
张峥 1陈明销 1李新宇 1程逸 1[ ... ]姚鹏 3,aff***
作者单位
摘要
1 中国科学技术大学工程科学学院精密机械与精密仪器系,安徽 合肥 230027
2 中国科学技术大学苏州高等研究院,江苏 苏州 215123
3 中国科学技术大学微电子学院,安徽 合肥 230027
宫颈异常细胞与正常细胞在形态上存在较大相似性且细胞尺寸变化较大,这使得宫颈异常细胞的精准检测变得非常困难。鉴于此,开发了一种基于Transformer模型的宫颈异常细胞自动识别模型,以帮助病理学家作出更准确的诊断。提出了两种创新性方法,一是一种改进的Transformer编码器结构,通过引入深度(DW)卷积来高效获取图像的特征,捕捉图像中的全局依赖信息;二是自适应的动态交并比(IOU)阈值,在模型训练的不同阶段使用不同的IOU阈值,实现尽可能多的有效检测,提升模型的收敛速度和检测精度。在宫颈异常细胞数据集上,通过消融实验,证明了改进的Transformer编码器和动态IOU阈值的有效性。此外,与已有的宫颈异常细胞识别方法相比,所提出的方法在平均精度指标上有明显的提高。实验结果表明,所提出的方法能够高效且准确地识别宫颈异常细胞,且能辅助病理专家提高诊断准确率和效率,具有应用到临床的潜力。
医用光学 宫颈细胞病理图像 目标检测 医学图像处理 
中国激光
2024, 51(3): 0307108
作者单位
摘要
1 重庆大学 光电技术与系统教育部重点实验室,重庆 400044
2 重庆大学附属肿瘤医院 头颈肿瘤中心,重庆 400030
提出了一种针对病理切片图像的端到端语义分割方法--边缘感知网络(BPNet),以提高病理图像分割精度。BPNet网络首先在解码器阶段增加边缘感知模块,改善网络对于病理图像边缘的特征信息提取能力。然后,采用自适应通道注意力模块弥补不同层次特征间的语义差距,进一步加强网络的特征聚合能力。在此基础上,设计了一种基于结构和边缘的联合损失函数,以实现最佳的病理图像分割结果。在GlaS和MoNuSeg两个公开病理数据集上的分割实验结果表明,所提方法的Dice系数得分在两个数据集上分别达到92.21%和81.18%,有效提升了病理图像的分割精度。
病理图像 自动分割 深度学习 边缘增强 联合损失函数 Pathological image Automatic segmentation Edge enhancement Joint loss function Deep learning 
光子学报
2024, 53(1): 0111003
作者单位
摘要
1 中国科学技术大学生物医学工程学院(苏州)生命科学与医学部,安徽 合肥 230026
2 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,江苏 苏州 215162
3 河南赛诺特生物技术有限公司,河南 郑州 450001
宫颈异常细胞特征细微难以提取、小目标容易漏检、细胞边界回归不准确导致异常细胞检测精度不高,鉴于此,本文提出了一种结合注意力的全尺度特征融合RetinaNet(AFF-RetinaNet)宫颈异常细胞检测算法。首先,采用ResNeSt-50作为特征提取网络提取宫颈异常细胞的细微特征;其次,引入平衡特征金字塔(BFP)结构,对所有特征层进行全尺度融合,增强小目标的语义信息,并利用BFP中的非局部注意力模块获取图像的全局信息,以进一步增强特征空间的语义信息;最后,采用CIoU Loss作为回归分支的损失函数,以提高对异常细胞边界回归的准确率。另外,针对实际应用场景,基于AFF-RetinaNet算法实现了全视野宫颈细胞病理学图像(WSI)推理流程,并基于该推理流程对WSI中的异常细胞进行了检测。AFF-RetinaNet在宫颈异常细胞数据集上的平均精度均值(mAP)为83.4%,其中对小目标的mAP值(mAP-s)达到了24.4%,相较于基准RetinaNet算法分别提高了3.2个百分点和10.8个百分点。基于AFF-Retina的WSI推理结果在感兴趣区域中的mAP为70.8%。实验结果表明:AFF-RetinaNet算法可以增强对小尺寸异常细胞的检测能力,有效提升宫颈异常细胞的检测精度。基于AFF-RetinaNet的宫颈WSI推理流程可辅助医生快速定位高分辨率宫颈WSI中的异常细胞,有望减轻医生的阅片负担。
医用光学 宫颈细胞病理图像 目标检测 小目标 特征融合 注意力机制 
中国激光
2023, 50(15): 1507203
高君朝 1,2黄丹飞 1,2,*张乐超 1,2宋东 3[ ... ]周尧 1,2
作者单位
摘要
1 长春理工大学 光电工程学院,长春 130022
2 长春理工大学中山研究院,中山 528437
3 吉林大学第一医院,长春 130021
改进原有背向穆勒矩阵成像装置,采集未染色肺癌、乳腺癌切片,基于穆勒矩阵各阵元的物理含义,借鉴光谱数据生成偏振立方体,纵向提取任意像素全阵元曲线,展示曲线特有的穆勒矩阵信息分析方式。采用夹角余弦曲线分类方法,对照病理标注生成混淆矩阵。其中肺癌、乳腺癌精度可达89.59%、87.82%,高倍率乳腺癌精度为77.52%。全阵元曲线较单一阵元分类准确率更高。本文方法的可视化分析、像素分类、跨尺度特性表明在偏振检测领域有很大的挖掘空间以及应用潜力。
偏振成像 穆勒矩阵 癌变组织 特征提取 病理切片检测 Polarization imaging Mueller matrix Cancerous tissue Feature extraction Pathological section detection 
光子学报
2023, 52(2): 0210003
作者单位
摘要
华南师范大学生物光子学研究院,广州 510631
深度学习使辅助诊断的软件能够更积极有效地开发和应用,但是组织病理学图像的颜色变化降低了这些算法的性能。染色归一化可以解决扫描仪效应、不同的染色方法、患者的疾病状态、染色时间等因素产生的图像异质性。虚拟染色可以摆脱载玻片染色,减少载玻片的制备步骤,为临床缩短样本的制备时间,节省大量的成本。在缺乏注释训练数据的情况下,病理图像数据增强可用于创建具有纹理和颜色、样式逼真的人工样本来促进网络训练。本文就组织学病理图像在深度学习病理分析中染色处理的染色归一化、虚拟染色和数据增强等方面展开综述,为组织学病理图像在临床上的应用和研究提供参考。
组织学病理图像 染色归一化 虚拟染色 数据增强 深度学习 histological pathology images staining normalization virtual staining data enhancement deep learning 
激光生物学报
2022, 31(6): 481
作者单位
摘要
1 海南省生物医学工程重点实验室, 海南大学 生物医学工程学院, 海南 海口 570100
2 海南大学 计算机科学与技术学院, 海南 海口 570100
数字病理凭借其便捷的存储、管理、浏览、传输等特点,为远程病理会诊及联合会诊带来了新契机。然而,显微镜的视场有限,在保证分辨率的前提下,无法兼顾全景成像。全景数字病理的提出弥补了这一缺陷,其在保证分辨率的同时可兼顾全景成像。但单张切片仅能实现单靶点检测,而疾病诊断需同时观测多个靶点的表达情况。近年来,多靶点全景数字病理技术发展迅速,因其在药物研发、临床科研以及基础科研等领域有巨大的应用潜力而广受关注。该系统凭借视场大、颜色多、通量高的特点,可在短时间内原位检测整张组织切片上的多种生物标记物的表达情况,借以识别组织上每个细胞表型、丰度、状态及其相互关系。本文首先梳理了数字病理、全景数字病理以及多靶点全景数字病理的发展过程,并简要介绍发展过程中技术的更新迭代,以及发展多靶点全景数字病理的重要性。然后,分别从生物样本准备、多色光学成像以及图像处理3个部分重点介绍多靶点全景数字病理。接下来,阐述了多靶点全景数字病理在肿瘤微环境与肿瘤分子分型等生物医学领域的应用情况。最后,对多靶点全景数字病理的技术优势、目前面临的挑战及其未来的发展趋势进行了总结。
多靶点全景数字病理 生物标记物 多色成像 图像处理 multi-target panoramic digital pathology biomarkers multi-color imaging image processing 
中国光学
2022, 15(6): 1258
作者单位
摘要
1 山东理工大学物理与光电工程学院, 淄博 255000
2 滕州市羊庄中心卫生院, 枣庄 277526
光声成像和激光诱导击穿光谱技术(LIBS)是近些年在成像领域发展非常迅速的两种技术, 在医学影像学方面有着巨大的潜力。当激光照射到组织时, 组织表面会同时产生光声信号和等离子体, 光声信号携带着生物组织内光吸收的特征信息, 等离子体特征光谱也可以示踪组织内的元素信息。本文总结了两种技术的研究背景和成像原理, 然后, 通过对光声成像和LIBS成像模式进行分析, 进一步展现了两种技术结合的可能性, 并介绍了它们在病理切片成像和组织金属元素示踪等领域的应用。最后, 我们对两种技术结合的双模态成像系统进行了深入的探讨和展望, 以期其在医学诊断和图像领域发挥重要作用。
光声成像 激光诱导击穿光谱技术 病理切片 元素示踪 双模态成像 photoacoustic imaging laser-induced breakdown spectroscopy pathological section element tracer bimodal imaging 
激光生物学报
2022, 31(5): 391
作者单位
摘要
南京航空航天大学自动化学院生物医学工程系,江苏 南京 211106

近年来,乳腺癌已成为威胁女性健康的头号恶性肿瘤,对其实现快速精准的筛查和诊断变得尤为重要。针对现有临床病理学检查需要染色突显细胞形态并依赖医生主观经验判断的局限性,立足于明场显微成像和偏振显微成像构建多模态显微成像技术,获取正常与癌变乳腺组织未染色冰冻切片的形态结构及其异质性信息并对之进行分析和诊断研究。首先对正常与癌变组织切片进行多角度正交偏振成像、明场显微成像并分析图像差异性;然后实施像素级图像融合;接着利用卷积神经网络模型,对多模态融合图像进行深度学习的特征提取与分类,有效提升准确率(0.8727)和受试者特征曲线下面积(AUC,0.9400)等参数,进而实现精准的乳腺癌智能诊断。该技术有助于医生进行快速准确的临床诊断,为实施乳腺癌术中快检以辅助精准手术治疗提供有效的技术手段,具有突出的临床潜力和应用前景。

医用光学 显微 多模态显微成像 偏振显微成像 明场显微成像 深度学习 乳腺癌病理诊断 
中国激光
2022, 49(24): 2407102

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