基于非凸L1-2正则化的生物发光断层成像仿真研究 下载: 636次
1 引言
生物发光断层成像(BLT)是一种新型的光学分子成像模态,它通过定位生物体内发光光源来定量地反映生物体分子细胞水平的生理和病理变化,在恶性肿瘤早期检测、药物开发及疗效评估等的应用中极具潜力[1-2]。
BLT通过生物体表面获取到的有限测量信息来估计生物内部自发荧光光源的分布,是一个典型的不适定逆问题,近红外光在生物组织中传播时要经历多次散射和吸收,更增加了光源重建的难度[3]。为了降低重建的病态性,通常需要在重建过程中融合可行区域[4]、多光谱测量 [5]、结构先验信息[6]等先验信息,以获得有意义的结果。受压缩感知理论的启发,Lu等[7]将光源的稀疏分布先验应用于BLT重建。随后,各种不同的稀疏重建算法相继被提出,如不完全变量截断共轭梯度算法(IVTCG)[8]、分段正交匹配追踪算法(StOMP)[9]以及各种基于非凸
压缩感知领域的研究表明,
2 方 法
2.1 BLT成像模型
近红外光在生物组织中传输时,辐射传输方程的扩散近似(DA)模型可以较为准确地描述这个过程。结合Robin边界条件的扩散近似模型可以描述为[2]
式中
在给定的光学参数下,基于有限元方法(FEM)[15]求解DA模型可得到表面测量值与内部光源间的线性对应关系:
式中:
由于测量得到的边界数据
式中
2.2 基于非凸L1-2正则化的BLT成像
为求解非凸的目标函数(3)式,采用凸差分算法[17],即利用凸差分算法函数
式中
当
式中
在每一步迭代中,还需要解决的
式中
式中
采用带自适应惩罚项的交替方向乘子法[18]对(7)式依次进行迭代求解:
利用下式对自适应惩罚因子进行变换:
式中
式中
基于非凸
1) 初始化设定
2) 当‖
3) 在满足上述条件下进行迭代求解。当‖
4) 直到
3 实验与结果
为了验证所提出的基于非凸
数字鼠模型采用的是Digimouse[20],在实验中截取数字鼠的躯干部分作为重建区域,躯干高34 mm,包括心脏、胃、肝脏、肾脏、肺等组织器官。单光源和双光源均设置为半径为0.5 mm、高为1 mm、初始能量密度为1 W/m3的小圆柱体。本研究采用中心定位误差(LE)评估所有算法的定位能力,采用算法耗时(
表 1. 数字鼠模型的光学参数[21]
Table 1. Optical parameters for the model of the digital mouse
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3.1 单光源数字鼠实验
在单光源实验中,光源放置在数字鼠的肝脏中,其中心点坐标设定为(9.2 mm,7.2 mm,19.2 mm)。为了得到模拟的表面测量数据,数字鼠模型在前向计算中被离散为一个包含14434个节点和80341个四面体单元的有限元网格。为提高算法效率和降低病态性,重建中采用了较为稀疏的逆向有限元网格,包含4600个节点和25069个四面体单元。
图 1. (a)数字鼠模型及单光源设置;(b)前向仿真得到的表面光强分布
Fig. 1. (a) Digital mouse model and source setting in single-source case; (b) surface intensity distribution generated by forward simulation
图 2. 单光源重建结果对比。(a) L1-2、(b) IVTCG、(c) SpaRSA、(d) StOMP重建结果的3D视图;(e) L1-2、(f) IVTCG、(g) SpaRSA、(h) StOMP重建结果在真实光源中心Z=19.2 mm处的 XY平面的截面视图,其中红色圆圈代表真实光源
Fig. 2. Comparison of reconstruction results in single-source case. 3D views of the reconstruction results by (a) L1-2, (b) IVTCG, (c) SpaRSA, (d) StOMP; transverse views at Z=19.2 mm of the reconstruction results by (e) L1-2, (f) IVTCG, (g) SpaRSA, (h) StOMP, where the red circle represents the real source
表 2. 单光源实验重建结果
Table 2. Reconstruction results in single-source case
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3.2 双光源实验
双光源实验评估的不仅是算法的中心定位能力,还有算法对双光源的空间分辨能力。实验中,双光源放置在肾脏中,中心坐标分别设定为(9.6 mm,15.3 mm,27.9 mm)和(12.5 mm,15.3 mm,27.9 mm)。前向计算时,有限元网格包含14752个节点和82148个四面体单元,而在逆向重建中数字鼠模型被离散为仅包含3878个节点和21199个四面体单元的网格。
3.3 稳健性测试
在实验测量中,噪声是不可避免的,对于不适定问题,算法的稳健性也是算法性能的重要评价指标。因此本节评估了不同噪声条件下,所提算法在单光源实验中的重建稳定性。设置的高斯白噪声水平分别为5%、10%、15%,鉴于噪声的随机性,在每个噪声水平下,重建算法独立运行10次,
图 3. (a)数字鼠模及双光源位置;(b)前向仿真得到的表面光强分布
Fig. 3. (a) Digital mouse model and sources setting in double-source case; (b) surface intensity distribution generated by forward simulation
图 4. 双光源重建结果对比。(a) L1-2、(b) IVTCG、(c) SpaRSA、(d) StOMP重建结果的3D视图;(e) L1-2、(f) IVTCG、(g) SpaRSA、(h) StOMP重建结果在真实光源中心Z=27.9 mm处的XY平面的截面视图,其中红色圆圈代表真实光源
Fig. 4. Comparison of reconstruction results in double-source case. 3D views of the reconstruction results by (a) L1-2, (b) IVTCG, (c) SpaRSA, (d) StOMP; transverse views at Z=27.9 mm of the reconstruction results by (e) L1-2, (f) IVTCG, (g) SpaRSA, (h) StOMP, where the red circle represents the real source
表 3. 双光源实验重建结果
Table 3. Reconstruction results in double-source case
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表 4. 不同噪声水平下的重建结果
Table 4. Reconstruction results under different noise levels
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4 结论
将一种新型的非凸
[4] 余景景, 王海玉, 李启越. 结合迭代收缩可行域的单视图多光谱生物发光断层成像[J]. 光学学报, 2016, 36(12): 1211001.
[16] Zhang HB, Geng GH, Wang XD, et al. Fast and robust reconstruction for fluorescence molecular tomography via L1/2 regularization[J]. BioMed Research International, 2016( 1): 1- 9.
[19] Wright S J, Nowak R D. Figueiredo M A T. Sparse reconstruction by separable approximation[J]. IEEE Transactions on Signal Processing, 2009, 57(7): 2479-2493.
余景景, 刘佳乐. 基于非凸L1-2正则化的生物发光断层成像仿真研究[J]. 中国激光, 2018, 45(4): 0407006. Yu Jingjing, Liu Jiale. Simulation of Bioluminescence Tomography Based on Nonconvex L1-2 Regularization[J]. Chinese Journal of Lasers, 2018, 45(4): 0407006.