作者单位
摘要
中国工程物理研究院激光聚变研究中心, 四川 绵阳 621900
持续一年的新冠疫情对全球的经济造成了巨大破坏, 为了有效控制新冠疫情, 快速检测新冠病毒(SARS-CoV-2)是一个急需解决的问题。 新冠病毒的刺突蛋白(spikeprotein)是拉曼光谱技术检测新冠病毒的检测点, 构建刺突蛋白拉曼特征峰模型对于发展拉曼检测技术快速检测新冠病毒具有重要作用。 基于简化的激子模型, 利用深度神经网络技术, 构建了刺突蛋白的酰胺Ⅰ、 Ⅲ特征峰模型, 并结合已知可以感染人类的七种冠状病毒(HCoV-229E, HCoV-HKU1, HCoV-NL63, HCoV-OC43, MERS-CoV, SARS-CoV和SARS-CoV-2)刺突蛋白的实验结构, 分析了七种冠状病毒刺突蛋白酰胺Ⅰ、 Ⅲ特征峰的区别。 计算结果表明, 七种冠状病毒可以根据毒刺突蛋白的酰胺Ⅰ、 Ⅲ特征峰划分为四个组: SARS-CoV-2, SARS-CoV, MERS-CoV形成一个组; HCoV-HKU1, HCoV-NL63形成一个组; HCoV-229E和HCoV-OC43各自独立形成一个组。 相同组的冠状病毒刺突蛋白酰胺Ⅰ、 Ⅲ峰频率较为接近, 通过酰胺Ⅰ、 Ⅲ峰的频率较难区分刺突蛋白; 不同组的冠状病毒刺突蛋白酰胺Ⅰ、 Ⅲ特征峰差异较大, 刺突蛋白可以通过拉曼技术区分开来。 该结果为发展拉曼检测技术快速检测新冠病毒提供了定性判断的理论依据。
冠状病毒 刺突蛋白 拉曼光谱 酰胺Ⅰ、 Ⅲ峰; 深度学习 Coronavirus Spike protein Raman spectrum Amide Ⅰ Ⅲ peak; Deep learning 
光谱学与光谱分析
2022, 42(9): 2757
Author Affiliations
Abstract
1 Institute for Solid State Physics and Optics Wigner Research Centre for Physics P.O. Box 49, H-1121 Budapest, Hungary
2 Institute of Physics, University of Szeged Dom ter 9, H-6720 Szeged, Hungary
3 Ministry of Higher Education and Scientific Research Baghdad 10065, Iraq
4 Physiology Department, College of Medicine University of Misan, Al-Amarah, Misan 62001, Iraq
5 Uzhhorod National University, Uzhhorod 88015 Transcarpathia, Ukraine
6 Science Medical Center, Saratov State University 83 Astrakhanskaya Str., Saratov 410012, Russia
7 Optoelectronics and Measurement Techniques Laboratory University of Oulu, 90570 Oulu, Finland
8 Laboratory of Laser Diagnostics of Technical and Living Systems Institute of Precision Mechanics and Control of the Russian Academy of Sciences 24 Rabochaya, Saratov 410028, Russia
9 Interdisciplinary Laboratory of Biophotonics National Research Tomsk State University 36 Lenin Avenue, Tomsk 634050, Russia
Confocal Raman microspectroscopy (CRM) with 633- and 785-nm excitation wavelengths combined with optical clearing (OC) technique was used for ex-vivo study of porcine skin in the Raman fingerprint region. The optical clearing has been performed on the skin samples by applying a mixture of glycerol and distilled water and a mixture of glycerol, distilled water and chemical penetration enhancer dimethyl sulfoxide (DMSO) during 30 min and 60 min of treatment. It was shown that the combined use of the optical clearing technique and CRM at 633nm allowed one to preserve the high probing depth, signal-to-noise ratio and spectral resolution simultaneously. Comparing the effect of different optical clearing agents on porcine skin showed that an optical clearing agent containing chemical penetration enhancer provides higher optical clearing efficiency. Also, an increase in treatment time allows to improve the optical clearing efficiency of both optical clearing agents. As a result of optical clearing, the detection of the amide-III spectral region indicating well-distinguishable structural differences between the type-I and type-IV collagens has been improved.
CRM skin collagen types I and IV amide III tissue optical clearing glycerol DMSO 
Journal of Innovative Optical Health Sciences
2021, 14(5): 2142003
作者单位
摘要
陕西师范大学 物理学与信息技术学院, 西安 710119
具有超顺磁性和荧光特性的CdTe@Fe3O4/P(NIPAM-co-AA)多功能复合微球是以P(NIPAM-co-AA)为模板制备而成.首先, 采用溶胀法使模板微球带有磁性; 其次, 辅助TEOS和APTES两种化学试剂实现对Fe3O4/P(NIPAM-co-AA)微球表面的氨基功能化; 最后, 携带氨基的磁性微球与巯基乙酸修饰的CdTe量子点通过酰胺缩合反应, 将量子点键合到磁性微球表面上,最终获得单分散的磁性荧光高分子复合微球.分别采用扫描电子显微镜、透射电子显微镜、倒置荧光显微成像系统、荧光分光光度计以及振动样品磁强计等方法对所获复合材料的结构与性能进行了表征.结果表明:复合微球单分散性良好, 平均粒径约为30 μm, 饱和磁化强度可达5.4 emu/g, 具有良好的超顺磁性和较高的荧光发光效率.该材料将磁性、荧光结合到微米级高分子共聚物上, 不仅解决了纳米粒子分离和处理的困难, 而且奠定了多功能材料在生物标记、荧光成像等诸多领域潜在的应用基础.
磁性 荧光 高分子 酰胺缩合 Fe3O4粒子 CdTe量子点 Amide condensation reaction CdTe quantum dots Fe3O4 particle Fluorescence Magnetism Polymer 
光子学报
2017, 46(4): 0431003
作者单位
摘要
1 广西大学 化学化工学院, 广西 南宁 530004
2 广西医科大学 第一附属医院, 广西 南宁 530021
3 南宁市化工研究设计院, 广西 南宁 530022
4 广西高校应用化学技术与资源开发重点实验室, 广西 南宁 530004
以香草酸为母体,分别与6-氨基己酸(EACA)、止血芳酸(AMBA)和止血环酸(AMCA)反应,合成3种未见文献报道的香草酸酰胺衍生物,并采用IR、ESI-MS、1H NMR和13C NMR进行结构鉴定。以传统方法、荧光动力学法和紫外动力学法测定其对血浆复钙时间(PRT)的影响。为了研究衍生物在血液中的稳定性,在模拟生理条件下,运用荧光光谱、紫外光谱及分子对接技术研究了它分别与人血清白蛋白(HSA)的结合。结果表明,3种衍生物在一定浓度范围内都可以有效缩短PRT,具有显著的止血活性。新的动力学测定方法,不仅有效避免了传统方法引入的人为误差,重现性良好,而且判断标准更加科学,并可以获得更多血浆凝结过程中的信息。3种衍生物均主要通过氢键和范德华力与HSA结合形成稳定的复合物,表明它可通过HSA在血液中传递并运输到相应部位而发生药理作用。
香草酸 酰胺衍生物 止血 人血清白蛋白(HSA) 光谱法 vanillic acid amide derivatives hemostasia human serum albumin (HSA) spectroscopic methodology 
发光学报
2016, 37(4): 487
作者单位
摘要
昆明理工大学材料科学与工程学院,云南 昆明 650093
本文采用傅里叶变换红外光谱仪对有机宝石犀角、玳瑁、珊瑚、珍珠、琥珀有机宝石的近红外光谱进行归属和对比研究。结果表明:有机宝石近红外光谱以氨基酸的倍频、组合频为主,其中较强的两个吸收谱带为6800 cm-1± NH 伸缩振动第一倍频,5100 cm-1± NH 伸缩振动和酰胺II (CN伸缩振动,NH 弯曲振动偶合产生,主要属于CN 伸缩振动)的组合频。该研究结果可为有机宝石的鉴别提供新的方法,也为有机宝石的成分研究提供了一定的信息。
有机宝石 近红外光谱 氨基酸 酰胺 organic gems near infrared spectroscopy amino acids amide 
红外技术
2016, 38(2): 0174
作者单位
摘要
1 鹿泉市动物卫生监督所, 鹿泉 050200
2 鹿泉市第一中学, 鹿泉 050200
3 石家庄学院 化工学院, 石家庄 050035
测定了不同温度下面粉蛋白质酰胺 Ⅲ 带的一维红外光谱,二阶导数红外光谱和去卷积红外光谱.研究发现:随着测定温度的升高,面粉蛋白质中的 α-螺旋结构的、β-转角结构、无规卷曲结构和 β-折叠结构红外吸收强度均有所增加.进一步研究了面粉蛋白质酰胺 Ⅲ 带的二维红外光谱.研究发现:随着测定温度的升高,面粉中蛋白质酰胺 Ⅲ 带的红外吸收强度变化快慢趋势是:1312 cm-1(α-螺旋结构)> 1285 cm-1(β-转角结构)> 1260 cm-1(无规卷曲结构)> 1229 cm-1(β-折叠结构).
一维红外光谱 二阶导数红外光谱 去卷积红外光谱 二维红外光谱 酰胺 Ⅲ 带 蛋白质二级结构 one-dimensional infrared spectroscopy second-derivative infrared spectroscopy deconvolution infrared spectroscopy two-dimensional infrared spectroscopy amide Ⅲ band protein secondary structure 
光散射学报
2015, 27(1): 82
作者单位
摘要
1 贵州师范大学化学与材料科学学院, 贵州 贵阳550001
2 CSIRO Materials Science and Engineering, PO Box 218, Lindfield, NSW 2070, Australia
合成并表征了有机配体2,6-双[N-(1′,1′-二甲基-2′-羟基)甲酰胺]吡啶(L)及其镍(Ⅱ)配合物, 采用元素分析确定目标配合物组成为C15H21N3O4Ni·H2O, 通过对比分析的方法讨论了配位前后游离配体L和镍(Ⅱ)配合物的核磁共振氢谱、 核磁共振碳谱、 红外吸收光谱和紫外-可见吸收光谱的谱学性质, 进而推断出镍(Ⅱ)配合物的结构。 结果表明, 配体2,6-双[N-(1′,1′-二甲基-2′-羟基)甲酰胺]吡啶以2个酰胺负离子N和1个吡啶环N原子为配位原子, 与中心金属离子Ni(Ⅱ)通过三齿形式配位; 配合物中Ni(Ⅱ)采取dsp2杂化轨道方式与配位原子构成配位键, 中心金属Ni(Ⅱ)的配位数为4, 1个Ni(Ⅱ)与1个三齿配体L和1个水分子配位, 形成平面正方形构型的低自旋镍(Ⅱ)配合物。
吡啶酰胺 镍(Ⅱ)配合物 光谱分析 Pyridine amide Nickel(Ⅱ) complex Spectral analysis 
光谱学与光谱分析
2012, 32(3): 805
作者单位
摘要
1 国家蔬菜工程技术研究中心, 北京市农林科学院蔬菜研究中心, 北京100097
2 江南大学食品科学与工程国家重点实验室, 江苏 无锡214122
使用圆二色性光谱和红外光谱技术对冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构进行了研究。 由于冬小麦麸皮抗冻蛋白在酰胺Ⅰ带和Ⅲ带位置中, 各个特征峰相互叠加, 因此采用Gausse峰型对圆头峰进行拟合、 解析, 判断其α-helix, β-sheet, β-turn和Random coil的相对含量; 同时对圆二色性光谱获得的结构信息, 采用按照Chen-Yang原理和最小二乘法编写的程序计算了冬小麦麸皮抗冻蛋白的二级结构。 最后, 讨论了两种检测方法结果差异的原因, 为冬小麦麸皮抗冻蛋白抗冻机理的研究奠定基础。
冬小麦麸皮抗冻蛋白 二级结构 傅里叶变换 红外光谱 圆二色性光谱 酰胺Ⅰ带和Ⅲ带 Winter-wheat-bran antifreeze protein Secondary structure Fourier transform infrared spectrum Circular dichroism spectrum Amide Ⅰ and Ⅲ 
光谱学与光谱分析
2009, 29(7): 1764
作者单位
摘要
中国工程物理研究院 流体物理研究所,绵阳 621900
通过不同功率的激光辐照芳纶纤维复合材料烧蚀实验回收样品的微观分析,得到在不同的激光参数下,芳纶纤维增强树脂基体复合材料的热损伤形态和损伤物理化学过程。结果表明,热损伤的关键在于化学变化,焦化和炭化使树脂和纤维剧烈收缩,收缩所产生的应力促使性能变坏的复合材料损伤。
激光 芳纶纤维 微观分析 热损伤 laser micro-analysis polyaryl amide fibers thermal damage 
激光技术
2006, 30(2): 0168

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