韩海丽 1王鹤 2董梦迪 1马芳芳 3[ ... ]韩彦卿 1,4,5,6,*
作者单位
摘要
1 山西农业大学 a. 植物保护学院
2 山西农业大学 b. 创新创业学院
3 山西农业大学 c. 农学院,太谷 030801
4 b. 创新创业学院
5 c. 农学院,太谷 030801
6 2. 杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室,太原 030031
谷子白发病是威胁谷子产量和品质的重要系统性侵染病害。在抵抗病原菌的过程中,抗病相关基因起着尤为重要的作用。几丁质酶(Chitinase,EC.3.2.1.14)是植物抗病反应过程中的一类重要的病程相关蛋白,在植物防御病原菌侵染和害虫危害中扮演重要的角色。本研究在前期对白发病菌侵染抗感谷子品种转录组分析的基础上发现几丁质酶家族基因在抗感品种中显著差异表达,推测该家族基因可能参与谷子对白发病的抗病反应过程。基于此,本研究运用生物信息学相关技术对筛选出的30个谷子候选抗病相关几丁质酶家族基因进行染色体定位,利用TBtools等软件对该基因家族的理化性质、基因结构、发育树构建、蛋白序列及其转录水平进行分析。结果表明,30 个谷子几丁质酶家族基因分布在8条染色体上(第6条染色体除外)。几丁质酶蛋白均含有分泌信号肽,预测为分泌蛋白,且具有保守蛋白基序。系统发育树分析显示,该基因家族成员可分为3个亚组。结合白发病菌侵染抗感谷子转录组数据,根据其表达模式的差异,可分为上调、下调和不表达3 类基因。荧光定量 PCR 结果表明,Seita.1G225300、Seita.4G286000、Seita.5G389900、Seita.7G150600、Seita.7G150700和Seita.8G076900这些基因表达在抗感品种中存在显著差异,很可能参与抗白发病的调控过程。其研究结果有望为谷子抗病基因克隆及分子育种提供一定的理论参考。
谷子 白发病菌 几丁质酶 基因家族 抗病 foxtail millet Sclerospora graminicola chitinase gene family disease resistance 
激光生物学报
2022, 31(4): 368
石尧 1,2尹美强 1,2,*温银元 1,2李露露 1,2[ ... ]高志强 1,2
作者单位
摘要
1 山西农业大学农学院, 太谷 030801
2 黄土高原特色作物优质高效生产省部共建协同创新中心, 太谷 030801
硒在植物体中有非常重要的生理生化功能及作用, 硫转运蛋白是主动转运硒酸盐的载体蛋白。从谷子基因组数据库中鉴定出SiSULTR2.1基因序列, 并进行生物信息学分析及叶面喷施Na2SeO4、Na2SO4表达响应分析, 旨在研究谷子中SiSULTR2.1基因的理化性质及Na2SeO4、Na2SO4处理表达响应, 为谷子SiSULTR2.1基因的硒、硫转运机制的研究提供理论依据。SiSULTR2.1蛋白分子质量为70 374.55 Da, 氨基酸数目为656个, 为疏水性、非分泌蛋白, 无信号肽, 二级结构由α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲构成, 包含硫转运蛋白所特有的STAS结构域和Sulfate-transp结构域。实时荧光定量RCR(qRT-PCR)分析发现, SiSULTR2.1具有组织表达特异性, 且在谷子茎、叶片中表达量较高。Na2SeO4、Na2SO4处理后的0~96 h内均可诱导SiSULTR2.1表达。SiSULTR2.1对Na2SO4的响应较快, 在12 h时达到峰值, 对Na2SeO4响应较慢, 处理后24 h时表达量高于对照组, 之后持续增加。这一研究结果为进一步阐述SiSULTR2.1基因的硒、硫转运机制提供了依据。
谷子 硫转运蛋白 表达分析 millet sulfate transporter expression analysis Na2SeO4 Na2SeO4 Na2SO4 Na2SO4 
激光生物学报
2022, 31(2): 157
作者单位
摘要
山西农业大学农学院, 太谷 030801
MYB-CC基因家族是由MYB-DNA结合域和CC(coiled-coil)结构域组成的, 其中CC结构域能通过折叠参与蛋白质之间的相互作用, 是一个二聚体结构域。这类MYB-CC转录因子是植物特有的, 除磷饥饿响应蛋白1(PHR1)外, 拟南芥中另外14个蛋白也同样具有这两个结构域。部分MYB-CC基因已经被证明可调控植物中磷酸盐吸收和控制磷饥饿反应。为了探索谷子MYB-CC基因家族的特征和功能, 本文通过生物信息学分析来解析谷子MYB-CC基因家族的特征, 分析其表达模式及谷子与水稻、玉米基因组中的MYB-CC基因家族的共线性、选择压力。结果表明: 通过基因在谷子染色体上的定位情况, 共筛选到谷子MYB-CC基因家族基因18个, 分布在7条染色体上; 基序分析发现存在1个相对保守的基序motif 1; 顺式作用元件分析发现, 参与防御和胁迫响应相关的MYB-CC基因有6个; 基因表达模式分析结果显示, SiMYB-CC6在根和茎秆中特异性表达。该研究结果可为谷子MYB-CC基因家族的进一步研究提供一定的参考依据。
谷子 MYB-CC基因家族 生物信息学 基因表达 低磷胁迫 foxtail millet MYB-CC gene family bioinformatics gene expression low phosphorus stress 
激光生物学报
2021, 30(3): 259
作者单位
摘要
山西农业大学农学院, 太谷 030801
缺磷已成为目前制约作物产量提高的非生物胁迫之一, 筛选作物耐低磷资源, 进行作物耐低磷育种已成为作物科学当前研究的热点之一, 因此植物体内磷含量的及时有效的监测也变得尤为重要。本文通过改良前后的钼锑抗比色法测定谷子新鲜幼嫩叶片和幼嫩根系的组织磷含量, 发现改良后的钼锑抗比色法所测的磷含量在一定范围内有良好的线性关系, 线性方程为y=1.060 3x-0.010 3, 线性相关系数达0.998 1。用该方法对谷子新鲜幼嫩叶片、幼嫩根系、成熟叶片、成熟根系、新鲜幼穗、成熟茎秆及液氮冷冻后的相应组织和谷子籽粒的磷含量以及不同磷浓度处理下(0.005、0.250 mmol/L)的谷子材料的磷含量进行测定, 进一步证实了其具有良好的灵敏度和精密度。该方法所测得的标准偏差较小, 在0~0.015 8范围之内; 相对标准偏差(RSD)的范围在0%~1.81%; 检出限的范围在0~0.047 4 μg/mL, 重复性较好,利用该方法还可有效地筛选具有磷吸收效率差异的谷子品种。改良后的钼锑抗比色法测定结果线性良好, 标准差低, 精密度很理想, 适合植物中低浓度磷的测定, 可为不同谷子材料总磷测定提供依据和参考。
谷子 钼锑抗比色法  测定方法 foxtail millet molybdenum-antimony anti-colorimetric method phosphorus assay method 
激光生物学报
2020, 29(3): 237
作者单位
摘要
山西农业大学农学院, 山西 晋中 030801
以“农大8号”和“长谷1号”2个谷子品种为试验材料, 分别以3 000 r/min、5 000 r/min、7 000 r/min进行离心30 min、60 min处理, 研究超重力处理对谷子种子发芽指标、萌发活力的影响以及萌发期丙二醛含量、过氧化物酶活性、超氧化物歧化酶活性的变化。结果表明, 中低速离心处理能促进种子萌发、根长及鲜质量, 各处理的芽长均下降; 两品种各处理组的丙二醛(MDA)含量都低于对照, 在处理7 000 r/min、30 min下达到最低; 除了在3 000 r/min、60 min处理下长谷1号的POD活性稍有下降外, 其余各处理两个品种的POD活性均高于对照, 长谷1号的POD活性在5 000 r/min、30 min下达到最大值, 农大8号的POD活性在处理时间60 min、转速(3 000 r/min、5 000 r/min)下达到最大; 两品种的SOD活性均高于对照组, 且在中高速(5 000 r/min、7 000 r/min)转速下SOD活性达到最大。超重力处理可提高谷子萌发期的抗逆性, 以5 000 r/min处理时间30 min、60 min 为宜。
超重力 谷子 种子萌发指标 生理生化指标 hypergravity millet seed germination index physiological and biochemical index 
激光生物学报
2018, 27(4): 367

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