作者单位
摘要
徐州医科大学附属医院消化内科,徐州 221004
基于生物信息学分析构建预后相关的预测模型,探讨铜死亡相关LncRNA与胃癌(GC)在免疫和预后方面的关系。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载胃癌患者的RNA测序和临床数据,基于共表达分析筛选出铜死亡相关LncRNA,通过LASSO 回归和多因素Cox 回归分析构建出与胃癌预后密切相关的铜死亡相关LncRNA风险预测模型,并计算所有胃癌患者样本的风险评分。通过Kaplan-Meier 生存分析、回归分析和受试者工作特征(ROC)曲线等证实模型的预后预测性能,并分析风险评分与通路富集分析、免疫浸润细胞、免疫检查点基因、体细胞基因突变及抗癌药物敏感性的相关性。差异表达分析结果表明,LncRNA HAGLR在肿瘤组织中的表达上调。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测LncRNA HAGLR在69例行根治性手术胃癌患者的癌组织及癌旁组织的表达。结果表明,相比于癌旁组织,胃癌组织中HAGLR表达上调,且与肿瘤大小、浸润深度、肿瘤TNM分期、分化程度及淋巴结转移成明显相关性(P<0.05)。本研究构建的铜死亡相关LncRNA预后模型具有较高的预测价值,并且与免疫细胞浸润异质性明显相关,在预测患者免疫治疗效果及指导化疗药物选择方面具有一定的临床价值。
铜死亡 胃癌 免疫逃避 预后 cuproptosis LncRNA LncRNA gastric cancer immune invasion prognosis 
激光生物学报
2023, 32(5): 0460
作者单位
摘要
徐州医科大学附属医院消化科,徐州 221004
铜死亡是一种新的程序性细胞死亡途径,由铜与脂酰化三羧酸循环蛋白直接结合而启动。调节肿瘤细胞中的铜死亡是一种新的治疗方法。然而,铜死亡相关长链非编码 RNA(LncRNA)在肝细胞癌( HCC)中的潜在作用和临床意义尚不明确。本研究基于 TCGA-LIHC数据集对 19个铜死亡相关基因进行共表达分析,共鉴定出 994个铜死亡相关 LncRNA。采用 LASSO回归和多因素 Cox回归分析筛选出 4个与铜死亡相关的预后 LncRNA(TMCC1-AS1、AC009974.2、AL355574.1和 DDX11-AS1)构建预后风险模型,并计算所有 HCC患者样本的风险评分。按 1:1的比例将肝癌患者分为高风险组和低风险组。 Kaplan-Meier生存曲线分析显示,高风险组患者的总生存率( OS)明显低于低风险组。回归分析和 ROC曲线证实了风险评分的预后价值。此外,本研究分析了风险评分与通路富集分析、免疫检查点基因、免疫细胞浸润、抗癌药物敏感性和体细胞基因突变之间的相关性。差异表达分析结果表明, TMCC1-AS1、AC009974.2、AL355574.1和 DDX11-AS1在肿瘤组织中的表达均升高。最后,利用收集的 8例行根治性手术肝癌患者的癌组织及癌旁肝组织进行实时荧光定量 PCR(qRT-PCR)验证,以增加本模型的组织学证据。本研究构建了一个由 4种铜死亡相关 LncRNA组成的风险模型,该模型与患者的预后及免疫浸润环境明显相关,在预测患者免疫治疗效果及指导化疗药物选择方面具有一定的临床应用价值。
肝细胞癌 铜死亡 免疫逃逸 肿瘤突变负荷 hepatocellular carcinoma cuproptosis immune escape tumor mutation burden LncRNA LncRNA 
激光生物学报
2023, 32(4): 0330
李小娜 1,2,3李开瑞 1,2,3宋岚 1
作者单位
摘要
1 湖南中医药大学医学院,长沙 410208
2 中医药防治眼耳鼻咽喉疾病湖南省重点实验室,长沙 410208
3 湖南省中医药防治眼耳鼻咽喉疾病与视功能保护工程技术研究中心,长沙 410208
长链非编码 RNA(lncRNA)是指长度大于 200 bp的非编码 RNA。在肺癌发生发展的过程中有大量 ln-cRNA的表达发生异常变化,这些 lncRNA主要通过调控肺癌细胞的增殖、凋亡、迁移、自噬等方面影响肺癌的病理生理过程。近些年,以 lncRNA为靶点的中药抗肺癌研究逐渐增多,本文主要就肺癌中异常表达的 lncRNA及其作用机制进行了综述,并概述了以 lncRNA为靶点的抗肺癌中药治疗进展,以期为肺癌的治疗和研究提供新方法和新思路。
肺癌 中药 诊断 治疗 lncRNA lncRNA lung cancer Chinese medicine diagnosis therapy 
激光生物学报
2020, 29(6): 489

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