王京 1,2刘博 1,2刘坤香 1,2陈福原 1,2李备 1,2,*
作者单位
摘要
1 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 应用光学国家重点实验室,长春 130033
2 中国科学院大学,北京 100049
在深海原位环境下精确捕获和收集单个目标微生物是当前深海微生物研究中的一大挑战。设计了一个应用在深海环境中的光镊捕获系统方案,系统包含光镊模块、微流控芯片、耐压外罩等部分,可实现原位捕获收集深海微生物。建立了位于南海北纬18°附近,1.5 km深处的海水折射率模型,预估了深海对光镊系统激光功率的损耗。使用T矩阵法计算对比了光镊在深海中和陆地上的纯水中对不同折射率和不同大小的球形微生物的捕获力。结果表明,相比于纯水中,光镊在1.5 km的深海中的最大轴向捕获力平均降低了25%,最大横向捕获力平均降低了20%。本研究可为未来基于光镊技术开发的深海微生物分选设备的下海实验提供参考。
光镊 光镊捕获力 T矩阵法 深海环境 深海微生物 海水折射率 Optical tweezers Optical tweezers capture force T-matrix Deep-sea environment Deep-sea microorganisms Refractive index of seawater 
光子学报
2024, 53(2): 0214001
作者单位
摘要
淡水鱼类发育生物学国家重点实验室, 微生物分子生物学湖南省重点实验室, 湖南师范大学生命科学学院, 长沙 410081
鱼体中的肠道微生物菌群是一道天然的免疫屏障, 能抑制病原微生物的定居和增殖, 从而使鱼体免受病害侵袭。洞庭湖是重要鱼类及水生生物的栖息地和基因库, 其中鲤形目(Cypriniformes)和鲈形目(Perciformes)种类最多, 鲇形目(Siluriformes)种类相对较少。洞庭湖鱼类群落结构及生物多样性已引起广泛关注, 但生态系统还是受到了一定程度的破坏, 很少有研究将其肠道微生物群的特征作为改善洞庭湖生态系统的潜在因素。为了探测洞庭湖重要鱼类中的微生物群, 使用16S rRNA高通量测序表征了鲇形目、鲈形目和鲤形目中6种鱼[黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)、鳜鱼(Siniperca chuatsi)、鲫鱼(Carassius auratus)、翘嘴鱼(Culter alburnus)、草鱼(Ctenopharyngodom idella)、鲢鱼(Hypophthalmichthys molitrix)]的肠道细菌群落多样性、组成和潜在的功能。所有鱼类肠道样本中有5种优势菌门, 包括厚壁菌门(Fimicutes)、变形杆菌门(Proteobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteriota)、放线菌门(Actinobacteriota)和蓝细菌门(Cyanobacteria)。鲤形目和鲈形目鱼类的细菌组成相似, 鲇形目中醋酸杆菌属(Cetobacterium)所占比例高, 而鲤形目中醋酸杆菌属和气单胞菌属(Aeromonas)所占比例均高。对这6种鱼类肠道微生物群的微生物群落的物种组成和功能进行预测, 发现鳜鱼肠道微生物菌群物种的丰富度最高, 并且代谢过程较为旺盛, 推测这可能与鲈形目的抗病能力和适应能力有关。深入了解鱼类肠道微生物菌群的多样性、组成与潜在功能, 不仅可以更好地对微生态制剂使用和其水质管理进行调控, 而且对鱼类的健康养殖具有重要的参考价值。
鱼类 肠道微生物种群 鲇形目 鲈形目 鲤形目 fish gut microbiota Cypriniformes Perciformes Siluriformes 
激光生物学报
2023, 32(2): 0153
李隆杰 1,2刘怡婷 1,2李丽 1张允雷 1,2,3[ ... ]柯章敏 1
作者单位
摘要
1 南京医科大学,附属江宁医院呼吸与危重症医学科,南京 211100
2 生物医学工程与信息学院,南京 211100
3 附属江宁医院中心实验室, 南京 211100
肿瘤微环境呈现出一个错综复杂的生态系统, 包括肿瘤细胞、非癌细胞、细胞外基质以及微生物群落等多种要素。微生物在肿瘤内广泛分布, 其在空间分布上呈现出显著的特异性。这些微生物的组成成分与功能状态在肿瘤的发生和进展中发挥着至关重要的作用。本文深入阐明了肿瘤微环境内微生物菌群的特征, 并探索其对肿瘤发生发展的影响机制, 以期为肿瘤的诊断和治疗提供全新的策略和视角。
肿瘤 肿瘤微环境 微生物 微生物群落 肿瘤诊疗 tumor tumor microenvironment microbe microbial community oncology treatment 
激光生物学报
2023, 32(5): 0385
作者单位
摘要
1 1.中国科学院大学 中丹学院, 北京 101408
2 2.中国科学院 生物物理研究所, 北京 100101
细菌和病毒一直对人类健康构成威胁。SARS-CoV-2已经在世界各地肆虐了近三年, 给人类健康带来了巨大危险。面对细菌的抗药性和抗生素治疗效果不佳等种种挑战, 人们迫切需要新的方法来对抗致病微生物。最近, 具有内在酶活性的纳米酶作为一种有前途的新型“抗生素”, 通过催化生成大量活性氧, 在生理条件下表现出卓越的抗菌和抗病毒活性。此外, 基于纳米酶的治疗中, 纳米材料在独特的物理化学特性(如光热和光动力效应)的帮助下可以增强治疗效果。本文综述了纳米酶在抗菌、抗病毒-方向的研究进展, 从机制角度系统总结分析了纳米酶消除细菌、病毒等微生物的原理, 对未来的新型纳米抗菌抗病毒材料的研发方向及其所面临的挑战进行了展望, 为开发下一代抗微生物感染纳米酶提供了思路。
纳米酶 微生物 催化 抗菌 抗病毒 综述 nanozyme anti-microbial catalyze antibacterial antivirus review 
无机材料学报
2023, 38(1): 43
作者单位
摘要
上海理工大学 光电信息与计算机工程学院,上海 200093
水源微生物检测在水源生物安全监测等方面具有非常重要的意义,而传统的显微镜观测等方法存在效率低、需要专业人员操作等不足,为此提出了一种水源微生物自动识别方法。采集水样,并制作水源微生物图像集,编写全自动与半自动两种图像分割算法用于提取目标微生物区域,并提取6种图像特征。基于以上特征数据,研究水源微生物识别模型的优化问题:首先,优化部分特征参数;接着,融合所有特征,建立粒子群优化算法的支持向量机(support vector machine optimized by particle swarm optimization, PSO-SVM)微生物识别模型,并与其他识别算法进行比较。结果表明,相比于其他3种算法,PSO-SVM能更有效地识别各种微生物,其平均识别率达到97.08%。
微生物识别 图像分割 粒子群算法 支持向量机 microorganisms recognition image segmentation particle swarm algorithm support vector machine 
光学仪器
2023, 45(2): 8
作者单位
摘要
中国地质大学(北京)工程技术学院, 北京 100083
黄土特殊的结构和矿物组成导致其遇水易崩解, 并引起边坡失稳、湿陷性沉降等一系列岩土工程问题。微生物诱导碳酸钙沉淀(MICP)技术是一种新型微生物矿化技术, 本文通过自制崩解仪探究了养护龄期和胶结液浓度对MICP改良黄土崩解时间和崩解率的影响, 根据非饱和土的单值有效应力公式, 从孔隙水压力和孔隙气压力的角度建立了非饱和土崩解的力学模型, 利用推导出的崩解率-时间公式拟合黄土试样的崩解曲线。结果表明: MICP改良试样的崩解率均低于未改良的试样; 随着养护龄期增加, 0.6 mol/L胶结液改良黄土的崩解时间由12 min增加到28 min; 养护14 d时, MICP改良黄土的崩解率达到最低值0.02%, 崩解率-时间公式对崩解率曲线的调整拟合优度均在0.90以上。
微生物诱导碳酸钙沉淀技术 黄土 崩解性 微分方程 孔隙气压力 曲线拟合 microbially induced calcite precipitation technolo loess disintegration property differential equation pore air pressure curve fitting 
硅酸盐通报
2023, 42(2): 674
作者单位
摘要
中国科学院苏州生物医学工程技术研究所医用检验技术研究室, 江苏 苏州 215163
病原微生物是指可侵犯人体, 引起感染的微生物, 临床上由病原微生物感染引发的疾病极为常见。 传统的临床病原菌诊断主要依赖于细菌培养, 但此方法耗时长, 往往需要2~5 d才能得到检测结果, 并且存在部分细菌培养困难甚至无法培养的问题。 在无法鉴别菌种以及药物敏感性的情况下医生凭借经验使用广谱抗生素, 加速了细菌耐药性的产生。 因此, 病原微生物的高灵敏快速检测方法研究成为重要研究方向。 拉曼光谱技术是一种对待测样品进行原位、 非侵入性检测的技术, 可在单细胞水平上提供微生物细胞中不同生物分子的指纹图谱信息, 通过这些信息可以确定微生物的种类、 生理特征和突变表型等, 实现对微生物样品的快速检测。 随着激光光谱学的快速发展以及临床需求的不断增加, 促使了以拉曼光谱检测技术为核心的亚技术诞生(如: 表面增强拉曼光谱技术、 傅里叶变换拉曼光谱技术、 激光共振拉曼光谱技术、 共聚焦显微拉曼光谱技术、 相干反斯托克斯拉曼光谱以及受激拉曼光谱等相关技术), 同时改善了以往拉曼光谱技术信号强度弱的不足, 以实现对微生物高精度的快速检测分析。 凭借着其具有对样本的状态没有限制以及能够检测物质成分微小变化的优势, 近年来对拉曼光谱在病原微生物领域的研究日渐增多。 对微生物检测的研究现状进行了调查和分析, 围绕着拉曼光谱技术原理对其在微生物检测中的应用进行了具体阐述, 其中主要对该技术在病原微生物鉴定以及药敏检测中的研究进展展开讨论, 并就其与传统检测技术之间的差别和优势进行分析, 展示了拉曼光谱技术作为病原微生物的快速检测新方法的前景。
拉曼光谱技术 病原微生物 快速检测 病原菌鉴定 药敏分析 Raman spectroscopy Pathogenic microorganism Rapid detection Pathogenidentification Antimicrobial susceptibility test 
光谱学与光谱分析
2022, 42(12): 3653
作者单位
摘要
1 天津城建大学材料科学与工程学院,天津 300384
2 天津城建大学,天津市建筑绿色功能材料重点实验室,天津 300384
3 天津大学,水利工程仿真与安全国家重点实验室,天津 300072
4 西安交通大学人居环境与建筑工程学院,西安 710049
针对当前基于微生物的外修复材料修复速率慢的技术难题,通过在现有微生物外修复材料体系中加入不同浓度(0.0%、0.5%、1.0%、1.5%和2.0%)的海藻酸钠形成微生物-海藻酸钠体系的外修复材料,并对其基本性质和协同外修复效果进行分析。结果表明:随着海藻酸钠浓度的增加,微生物-海藻酸钠体系的外修复材料的黏度和流动度表现不同规律,其中黏度呈现出逐渐增大,而流动度表现为逐渐降低的规律。微生物-海藻酸钠的外修复材料所形成修复产物呈白色,具有一定弹性,修复产物组成以碳酸钙为主,同时形成的海藻酸钙凝胶填充在碳酸钙间的空隙中。对于不同宽度裂缝,微生物-海藻酸钠的外修复材料所形成微生物海藻酸钙水凝胶均可以实现瞬时堵漏,使得试样渗水系数减低,抗压强度提高。尤其对于1.0 mm裂缝,使用海藻酸钠浓度为0.5%时的修复效果最好,保持水压为1 kPa作用下可以使渗水系数由9.76降至0,同时7 d时的强度恢复率可达到22.7%。
微生物 海藻酸钠 混凝土 裂缝修复 microorganism sodium alginate concrete crack repair 
硅酸盐学报
2022, 50(8): 2087
作者单位
摘要
1 青岛理工大学土木工程学院,山东 青岛 266033
2 中国海洋大学工程学院,山东 青岛 266100
混凝土材料在实际服役阶段常常受到力学和环境因素的耦合作用,因“湿-热-化学-力”复杂应力使其内部较易产生微裂缝,有利于水分及腐蚀性离子的侵入,从而加速了钢筋混凝土结构耐久性劣化过程。为了延缓严酷环境下混凝土力学及耐久性能劣化过程,目前学者们通过微生物矿化技术对混凝土裂缝自愈合机理展开了大量研究。基于混凝土自愈合机理,针对微生物愈合的实现方式及其对耐久性的影响,对矿化作用下水泥基材料微生物自愈合研究进行了总结和讨论,最后综述了不同类型微生物诱导碳酸钙沉淀技术在水泥基材料中的应用。
混凝土 矿化作用 微生物 自愈合 耐久性 concrete mineralization microbe self-healing durability 
硅酸盐学报
2022, 50(2): 544
德吉卓嘎 1,2王玮 1,2德吉措姆 1,2田蕾 3[ ... ]高鹏 4,5,*
作者单位
摘要
1 西藏自治区食品药品检验研究院拉萨 850000
2 (国家药品监督管理局中药(藏药)质量控制重点实验室 拉萨 850000)
3 四川大学成都 610000
4 四川省原子能研究院成都 610101
5 辐照保藏四川省重点实验室成都 610101
为研究电子束辐照对藏药八味沉香散灭菌效果和其有效成分的影响,采用电子束(0 kGy、5 kGy、7 kGy、10 kGy)和60Co γ(7 kGy)辐照三个厂家生产的产品,分别在处理后以及在49 ℃加速贮藏3个月后检测微生物指标和有效成分的变化。结果表明:经不同剂量处理后,电子束辐照和60Co γ辐照均能显著降低八味沉香散内微生物数量至达标;电子束5 kGy辐照后,样品的微生物总数已降低至《中国药典》的要求限度,且其有效成分没有明显变化,吸收剂量至10 kGy时,对其有效成分含量也基本无影响。因此,电子束辐照可以有效提高八味沉香散的卫生指标,5 kGy为八味沉香散的最佳辐照工艺剂量。
电子束 辐照灭菌 八味沉香散 微生物存活数 有效成分 Electron beam Irradiation sterilization Bawei Chenxiang powder Total number of microorganisms Active ingredients 
辐射研究与辐射工艺学报
2022, 40(5): 050402

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