1 长春理工大学 生命科学技术学院, 吉林 长春 130022
2 河南科技学院新科学院 生物与化学工程系, 河南 新乡 453003
在pH 7.4的Tris-HCl缓冲溶液中, 采用紫外吸收光谱、荧光光谱结合溴化乙锭(EB)荧光探针、共振散射光谱以及DNA熔点(Tm)实验和分子模拟等技术, 研究了青蒿素(QHS)与小牛胸腺DNA(ctDNA)分子间结合位点与结合机制。光谱实验结果显示, QHS与DNA发生减色效应, QHS的加入使EB-DNA体系发生静态荧光猝灭, QHS与DNA作用后其467 nm处共振散射峰锐增, 与QHS作用引起DNA的Tm值升高5 ℃, 说明QHS竞争性地嵌插入DNA的碱基对中。通过计算获得QHS与DNA间结合常数Ka为1.43×103 L/mol(298 K)、0.99×103 L/mol(304 K)。分子模拟结果表明, QHS吡喃环部分结构嵌插到DNA小沟区域GA碱基对间, 氢键和范德华力是两者间结合的主要非共价作用方式, 该结论与光谱法和热力学所得结果一致。
青蒿素 小牛胸腺DNA 多种光谱技术 分子模拟 artemisinin calf thymus DNA multi-spectroscopic techniques molecular modeling
1 长春理工大学 清洁能源技术研究所, 吉林 长春 130022
2 长春理工大学 生命科学技术学院, 吉林 长春 130022
在pH 7.4的生理条件下, 以溴化乙锭(EB)作为荧光探针, 利用荧光光谱、紫外-可见吸收光谱、共振散射光谱法结合盐效应和DNA熔点(Tm)实验研究了柯里拉京(Cor)与小牛胸腺DNA分子之间的相互作用机制。实验结果表明, Cor静态猝灭DNA-EB体系的荧光。Cor与DNA作用后, 其特征吸收峰强度发生减色效应; 与DNA作用导致Cor在480.5 nm处的共振散射峰增强, 并在330.2 nm处出现新共振散射峰。盐效应对Cor与DNA分子相互作用的影响较小。与Cor作用引起DNA的Tm值升高5.5 ℃。由此推断, Cor与DNA相互作用的主要方式为嵌插, 两者间形成了超分子体系。通过计算获得Cor与DNA间结合常数(KA)为5.82×103 L/mol (298 K)、2.47×104 L/mol (310 K), 它们之间的作用为熵驱动的自发、吸热过程, 疏水作用力是主要的非共价作用方式。
柯里拉京 小牛胸腺DNA 光谱学 嵌插 反应机理 corilagin calf thymus DNA spectra method intercalation reaction mechanism
河北大学化学与环境科学学院 药物化学与分子诊断教育部重点实验室, 河北 保定071002
用荧光光谱法研究了拜复乐(MXFX)与小牛胸腺DNA(ctDNA)之间的相互作用。在pH=7.4的Tris-HCl缓冲溶液中, MXFX的荧光激发峰和发射峰分别位于291 nm和462 nm。ctDNA的加入对MXFX的荧光有静态猝灭作用, 这种荧光静态猝灭作用是由ctDNA和MXFX结合引起的, 作用力为氢键或范德华力, 结合常数为1.28×105 L/mol(25 ℃)。采用离子强度的影响、碘离子猝灭及溴乙锭竞争作用实验研究了MXFX与ctDNA间的相互作用, 结果表明MXFX与DNA的结合是MXFX嵌入到DNA中相邻2个碱基对之间, 属于嵌入结合模式。
拜复乐 小牛胸腺DNA 荧光光谱法 作用机理 moxifloxacin ctDNA fluorescence spectroscopy interaction mechanism
1 内蒙古大学 化学化工学院, 内蒙古 呼和浩特010021
2 内蒙古化工职业学院, 内蒙古 呼和浩特010011
合成了以水杨醛甘氨酸席夫碱(Sal-GlyK)、邻菲罗啉(Phen)和2,2′-联吡啶(Bipy)为配体、Eu3+、La3+为中心的配合物。对其进行了元素分析和摩尔电导、红外光谱及紫外吸收光谱测定, 推测配合物的组成分别为RE(Sal-Gly)(NO3)·2H2O和RE(Sal-Gly)(Phen)(NO3)·H2O、RE(Sal-Gly)(Bipy)(NO3)·H2O(RE3+=Eu3+, La3+)。通过紫外吸收光谱及荧光光谱研究了稀土配合物与小牛胸腺DNA的作用方式及其结合常数。结果表明, 本文合成的配合物与DNA的结合能力的顺序为RE(Sal-Gly)(Phen)(NO3)·H2O＞RE(Sal-Gly)(Bipy)(NO3)·H2O ＞RE(Sal-Gly)(NO3)·2H2O, 表明配合物是以插入方式与DNA结合, 含有良好平面性和较大表面积配体的配合物可以更好地插入到DNA的碱基对中。
稀土配合物 水杨醛甘氨酸席夫碱 小牛胸腺DNA 插入作用 rare earth complexes salicylideneglycine schiff base CT-DNA intercalation model
1 中山大学化学与化学工程学院, 广东 广州 510275
2 中国科学院广州地球化学研究所, 广东 广州 510640
研究了DNA与铜(Ⅱ)-L丝氨酸-二吡啶并［3,2-a: 2′,3′-c］吩嗪配合物［Cu(DPPZ)(L-Ser)］+相互作用的共振光散射光谱和紫外可见吸收光谱, 通过研究体系与溴化乙啶相互作用的荧光光谱特征, 证明其作用方式为插入作用。 在pH 7.2的缓冲溶液中, ［Cu(DPPZ)(L-Ser)］+由于插入作用而在DNA表面聚集, 使体系的共振光散射强度增强, 最大散射峰在400 nm处。 在最佳实验条件下, 共振光散射增强的强度与浓度在0.42～4.20 ng·mL-1范围的DNA具有良好的线性关系。 方法的检出限为0.29 ng·mL-1。 该法用于DNA样品的测定, 回收率在97.8%～106.0%之间。
共振光散射 铜 L-丝氨酸 二吡啶并吩嗪 小牛胸腺DNA Resonance light scattering Copper L-serine Dipyrido［3 2-a 2′ 3′-c］phenazine Calf thymus DNA 光谱学与光谱分析
2011, 31(4): 1057
浙江大学环境科学研究所, 污染环境修复与生态健康教育部重点实验室, 浙江 杭州 310029
采用紫外光谱、 荧光光谱、 荧光偏振以及K3Fe(CN)6荧光猝灭实验研究了氧氟沙星(Ofloxacin, OFLX)和左氧氟沙星(Levofloxacin, L-OFLX)与小牛胸腺DNA(ctDNA)的相互作用差异性与作用模式。 紫外光谱的结果表明, 当向OFLX和L-OFLX溶液中加入ctDNA并且浓度增大时, OFLX和L-OFLX的吸收光谱都呈现略微的减色效应, 但吸收峰位置没有发生偏移, L-OFLX的减色效应略强于OFLX的减色效应； 从荧光光谱以及OFLX和L-OFLX的Scatchard方程, 获得其键合常数分别为1.15×105 L?mol－1, 3.75×105 L?mol－1, 表明L-OFLX与ctDNA的相互作用要略强于OFLX与ctDNA的相互作用； 荧光偏振实验、 单双链ctDNA与药物作用实验、 K3Fe(CN)6荧光猝灭实验都表明OFLX、 L-OFLX与ctDNA的作用模式可能是沟槽结合。
小牛胸腺DNA 左氧氟沙星 氧氟沙星 相互作用 光谱法 Calf thymus DNA Levofloxacin Ofloxacin Interaction Spectroscopy
1 中国农业大学理学院, 北京 100094
2 山西农业大学文理学院, 山西 太谷 030801
农用化学物质残留可能会与DNA结合形成加和物, 从而对动物和人类造成危害。 文章利用紫外光谱和荧光光谱研究了溴鼠灵(BDF)与小牛胸腺DNA(ct-DNA)的作用机理。 结果表明, 低浓度的ct-DNA可使BDF的吸收光谱发生减色, ct-DNA对BDF的稳态荧光有明显的的猝灭作用, 属于静态猝灭方式, 27 ℃时KSV=1.21 104 L·mol-1； 根据热力学参数推测BDF与ct-DNA之间的相互作用主要是范德瓦耳斯力作用； 猝灭试验发现ct-DNA对BDF无明显保护作用； 离子强度改变时, BDF/ct-DNA体系的荧光强度也随之改变； ct-DNA对β-CD/BDF包络物的荧光也有猝灭, 但猝灭程度比游离的BDF有所降低, 表明β-CD对BDF具有保护作用, 也说明BDF与ct-DNA或β-CD的结合具有竞争性。 各试验结果一致表明BDF与ct-DNA之间主要是以沟区结合方式发生作用。 另外, 试验结果也表明BDF与ct-DNA之间还存在静电作用。 范德瓦耳斯力和静电作用的共同作用, 为BDF在沟区与DNA的相互结合提供了更好条件。
溴鼠灵 小牛胸腺DNA 荧光光谱 紫外光谱 沟区结合 Brodifacoum Calf thymus DNA Fluorescence spectrum UV spectrum Groove binding
贵州省光电子技术与应用重点实验室,贵州大学 理学院物理系,贵州 贵阳 550025
低功率密度的He-Ne激光照射DNA固体纤维后,构象仍为A型。照射时间很短时,激光对磷酸骨架结构基本无影响,对氢键和碱基有轻微损伤。随着照射时间延长,部分磷酸二酯键 和氢键断裂。继续照射,激光先是对DNA的损伤有所减少,然后又使DNA的损伤加剧。但磷酸骨架基团损伤程度减小的时间早于氢键损伤程度减小的时间。在较长时间照射后激光对DNA损伤程度反而降低的机制目前并不清楚。激光对大部分碱基的影响是先破坏与DNA垂直的碱基-碱基堆积相互作用,再使碱基之间氢键受损和断裂。
He-Ne激光 小牛胸腺DNA 诱变 拉曼光谱 He-Ne laser calf thymus DNA induce Raman spectroscope
Author Affiliations
Abstract
1 State Key Laboratory of Precision Spectroscopy, Department of Physics, and Department of Chemistry, East China Normal University, Shanghai 200062
2 Department of Physics and Electronics, Henan University, Kaifeng 475003
Dependence of surface-enhanced Raman scattering (SERS) from Calf thymus DNA on anions is investigated. With the silver colloid, the bands at 732, 960 and 1333 cm-1 for adenine (A), 1466 cm-1 for deoxyribose, and 1652 cm-1 for the C=O group of thymine (T) are observably enhanced. With the presence of the Cl- or SO^(2-)_(4) anions, the bands at 732 and 1326/1329 cm-1 for the symmetric stretching and skeletal vibrational modes of adenine (A) are dramatically enhanced, and the enhancement effect with the SO^(2-)_(4) ion is more than that with the Cl_ ion. The experimental results show that the DNA molecule can be adsorbed on the silver colloid particles through the C6N and N7 of adenine (A), the C=O of thymine (T) and deoxyribose. Moreover, the formed hydrogen bonding of the Cl_ or SO^(2-)_(4) ions to the C6NH2 group of adenine (A) can induce larger C6N electronegativity, which is favor for the C6N/N7 cooperative adsorption on the (Ag)^(+)_(n) colloid particles.
表面增强拉曼散射 阴离子影响 小牛胸腺DNA 氯离子 硫酸根离子 170.5660 Raman spectroscopy 300.6450 Spectroscopy, Raman 290.5860 Scattering, Raman 170.0170 Medical optics and biotechnology Chinese Optics Letters
2008, 6(7): 526
1 安徽大学生命科学学院,中国安徽,合肥,230039
2 中国科学院安徽光机所,中国安徽,合肥,230031
XeCl 308 nm紫外激光(单脉冲输出能量33.4 mJ,脉冲频率 2次/秒,辐照时间45秒,光斑6×3 mm,透镜焦距300 mm)辐照330 mm处小牛胸腺DNA(固体).用扫描电子显微镜和透射电子显微镜可以观察到DNA受照射后有断裂、分叉、扭曲、聚集和交联等现象,影响生物大分子的初级结构和高级结构的变化.在我们的实验条件下是以影响DNA构象变化为主.
准分子激光器 辐照 小牛胸腺DNA 结构变化 XeCl XeCl excimer laser radiation BTG DNA structure change
